Hvad er de forskellige typer RNA-isolationssæt?

De fleste ribonukleinsyreisolationssæt (RNA) kan isolere høj kvalitet af RNA fra en lang række væv og typer organismer, herunder planter, dyr og vira. Mitochondrial og ribosomal RNA - henholdsvis mRNA og rRNA - kan kræve specialiserede RNA-isoleringssæt, der er specifikke for små RNA-strenge. Andre faktorer, der kan variere mellem forskellige isolationssæt, er mængden af ​​prøver, som hvert kit kan behandle, og den tid det tager at fuldstændigt behandle en prøve.

De mest almindelige typer RNA-isolationssæt kan bruges til en lang række anvendelser, uanset hvor RNA kommer fra. Pattedyrceller og væv er blandt de mest dominerende kilder, der anvendes til RNA-isolering og oprensning. Plante celler og vira bruges også i molekylærbiologiske eksperimenter, der kræver anvendelse af et RNA-isoleringssæt.

Når vævet eller blodprøven er samlet, skal den være forberedt til RNA-isolering under en kritisk proces, der kaldes cellulær nedbrydning, separering eller forstyrrelse. Hvis det cellulære materiale ikke er afsluttet forstyrret, producerer RNA-isoleringsprocessen mindre RNA. De bedste RNA-isolationssæt inkluderer materialer og forsyninger til cellulær nedbrydning inden isolering og RNA-oprensning efter isolering.

I særlige tilfælde, hvor et eksperiment kræver mRNA eller rRNA, er der specialiserede RNA-isolationssæt til rådighed for RNA-strenge, der er særlig små. Materialerne og forsyningerne inkluderet i et sådant sæt kan være forskellige med hensyn til mængde og størrelse. Disse RNA-isoleringssæt er mindre almindelige end RNA-multifunktionssættene, og der kan være en betydelig omkostningsforskel.

Mange almindelige RNA-isolationssæt er designet til brug med alle typer væv og celler og kan afslutte en reaktion inden for ca. 20 minutter. Tiden det tager for komplet cellulær nedbrydning kan variere afhængigt af hvor i organismen cellerne blev opsamlet. Ud over trinnet med cellulær nedbrydning er RNA-isoleringsprocessen og efterfølgende oprensning relativt standard med hensyn til procedure og tid.

En anden funktion, der kan være specifik for visse sæt er den mængde prøve, der kræves for at behandle reaktionen. Mens nogle isoleringssæt muligvis kræver et relativt stort prøvevolumen, kan andre sæt fungere godt med et mindre volumen. Denne forskel kan være en fordel, hvis prøvevolumen er en begrænsende faktor.

Flere producenter af RNA-isolationssæt har sammenligningstabeller tilgængelige på Internettet. Disse diagrammer kan bruges til at se forskellene mellem de forskellige sæt, de producerer. Forskellene kan omfatte specialiserede applikationstyper, kemikalier og nødvendige prøvevolumener.