Hvad er de forskellige typer RNA -isoleringssæt?
De fleste ribonukleinsyre (RNA) isoleringssæt kan isolere RNA af høj kvalitet fra en lang række væv og typer organismer, herunder planter, dyr og vira. Mitochondrial og ribosomalt RNA - henholdsvis mRNA og RRNA - kan kræve specialiserede RNA -isoleringssæt, der er specifikke for små strenge af RNA. Andre faktorer, der kan variere mellem forskellige isoleringssæt, er mængden af prøver, som hvert kit kan behandle, og den tid det tager at behandle en prøve.
De mest almindelige typer RNA -isoleringssæt kan bruges til en lang række anvendelser, uanset hvor RNA kommer fra. Pattedyrceller og væv er blandt de mest dominerende kilder, der anvendes til RNA -isolering og oprensning. Planteceller og vira anvendes også i molekylærbiologiske eksperimenter, der kræver anvendelse af et RNA -isoleringssæt.
Når vævet eller blodprøven er opsamlet, skal det være forberedt til RNA -isolering under en kritisk proces kendt som cellulær nedbrydning, separatipå eller forstyrrelse. Hvis det cellulære materiale ikke er afsluttet forstyrret, vil RNA -isoleringsprocessen producere mindre RNA. De bedste RNA -isoleringssæt inkluderer materialer og forsyninger til cellulær nedbrydning inden isolering og RNA -oprensning efter isolering.
I specielle tilfælde, hvor et eksperiment kræver mRNA eller rRNA, er specialiserede RNA -isoleringssæt tilgængelige for RNA -strenge, der er særligt små. Materialerne og forsyningerne, der er inkluderet i et sådant kit, kan være forskellige med hensyn til mængde og størrelse. Disse RNA-isoleringssæt er mindre almindelige end multi-purpose RNA-sæt, og der kan være en betydelig omkostningsforskel.
Mange almindelige RNA -isoleringssæt er designet til brug med alle typer væv og celler og kan gennemføre en reaktion inden for cirka 20 minutter. Den tid det tager for fuldstændig cellulær nedbrydning kan variere afhængigt af hvor i organismen cellerne var COLvalgt. Ud over trinnet med cellulær nedbrydning er RNA -isoleringsprocessen og efterfølgende oprensning relativt standard med hensyn til procedure og tid.
En anden funktion, der kan være specifik for visse sæt, er mængden af prøve, der kræves for at behandle reaktionen. Mens nogle isoleringssæt kan kræve et relativt stort prøvevolumen, kan andre sæt fungerer godt med et mindre volumen. Denne forskel kan være en fordel, hvis prøvevolumen er en begrænsende faktor.
Flere producenter af RNA -isoleringssæt har sammenligningsdiagrammer tilgængelige på Internettet. Disse diagrammer kan bruges til at se forskellene mellem de forskellige sæt, de producerer. Forskellene kan omfatte specialiserede applikationstyper, kemikalier og nødvendige prøvevolumener.