Vilka är de olika typerna av RNA-isoleringssatser?
De flesta isoleringssatser för ribonukleinsyra (RNA) kan isolera högkvalitativt RNA från ett brett spektrum av vävnader och typer av organismer, inklusive växter, djur och virus. Mitokondriell respektive ribosomal RNA - mRNA respektive rRNA - kan kräva specialiserade RNA-isoleringssatser specifika för små RNA-delar. Andra faktorer som kan skilja sig mellan olika isoleringssatser är mängden prover som varje kit kan behandla och den tid det tar att fullständigt bearbeta ett prov.
De vanligaste typerna av RNA-isoleringssatser kan användas för en stor variation av applikationer, oavsett var RNA kommer från. Däggdjursceller och vävnader är bland de mest dominerande källorna som används för RNA-isolering och rening. Växtceller och virus används också i molekylärbiologiska experiment som kräver användning av ett RNA-isoleringssats.
När vävnads- eller blodprovet har samlats måste det förberedas för RNA-isolering under en kritisk process som kallas cellnedbrytning, separering eller störning. Om det cellulära materialet inte avslutas störs kommer RNA-isoleringsprocessen att producera mindre RNA. De bästa RNA-isoleringssatserna inkluderar material och tillförsel för cellnedbrytning före isolering och RNA-rening efter isolering.
I speciella fall där ett experiment kräver mRNA eller rRNA finns specialiserade RNA-isoleringssatser tillgängliga för RNA-strängar som är särskilt små. Materialen och tillbehören som ingår i ett sådant kit kan vara olika vad gäller kvantitet och storlek. Dessa RNA-isoleringssatser är mindre vanliga än RNA-satserna med flera ändamål, och det kan vara en betydande kostnadsskillnad.
Många vanliga RNA-isoleringssatser är utformade för användning med alla typer av vävnader och celler och kan fullborda en reaktion inom ungefär 20 minuter. Tiden det tar för fullständig cellnedbrytning kan variera beroende på var i organismen cellerna samlades. Utöver steget med cellnedbrytning är RNA-isoleringsprocessen och efterföljande rening relativt standard vad gäller procedur och tid.
En annan funktion som kan vara specifik för vissa satser är mängden prov som krävs för att behandla reaktionen. Medan vissa isoleringssatser kan kräva en relativt stor provvolym, kan andra kit fungera bra med en mindre volym. Denna skillnad kan vara en fördel om provvolymen är en begränsande faktor.
Flera tillverkare av RNA-isoleringssatser har jämförelsediagram tillgängliga på Internet. Dessa diagram kan användas för att se skillnaderna mellan de olika satserna de producerar. Skillnaderna kan inkludera specialiserade applikationstyper, kemikalier och erforderliga provvolymer.