Jakie są różne rodzaje zestawów izolacyjnych RNA?
Większość zestawów izolacyjnych kwasu rybonukleinowego (RNA) może izolować wysokiej jakości RNA z szerokiej gamy tkanek i rodzajów organizmów, w tym roślin, zwierząt i wirusów. Mitochondrialny i rybosomalny RNA - odpowiednio mRNA i rRNA - może wymagać wyspecjalizowanych zestawów izolacji RNA specyficznych dla małych pasm RNA. Inne czynniki, które mogą się różnić między różnymi zestawami izolacyjnymi, to ilość próbek, które każdy zestaw może przetwarzać i czas potrzebny do całkowitego przetworzenia próbki.
Najczęstsze rodzaje zestawów izolacyjnych RNA można wykorzystać do dużej różnorodności zastosowań, niezależnie od tego, skąd pochodzi RNA. Komórki i tkanki ssaków należą do najważniejszych źródeł wykorzystywanych do izolacji i oczyszczania RNA. Komórki roślinne i wirusy są również stosowane w eksperymentach biologii molekularnej, które wymagają zastosowania zestawu izolacji RNA.
Po zebraniu tkanki lub próbki krwi należy przygotować do izolacji RNA podczas krytycznego procesu znanego jako degradacja komórkowa, separatina lub zakłócenie. Jeśli materiał komórkowy nie zostanie ukończony zakłócony, proces izolacji RNA spowoduje mniejsze RNA. Najlepsze zestawy izolacji RNA obejmują materiały i materiały do degradacji komórkowej przed izolacją i oczyszczaniem RNA po izolacji.
W specjalnych przypadkach, w których eksperyment wymaga mRNA lub rRNA, wyspecjalizowane zestawy izolacji RNA są dostępne dla szczególnie małych pasm RNA. Materiały i zapasy zawarte w takim zestawie mogą być różne pod względem ilości i wielkości. Te zestawy izolacji RNA są mniej powszechne niż wielofunkcyjne zestawy RNA i mogą istnieć znaczna różnica kosztów.
Wiele popularnych zestawów izolacji RNA zostało zaprojektowanych do stosowania ze wszystkimi rodzajami tkanek i komórek i może zakończyć reakcję w ciągu około 20 minut. Czas potrzebny na całkowitą degradację komórkową może się różnić w zależności od tego, gdzie w organizmie komórki były colwybrane. Oprócz etapu degradacji komórkowej proces izolacji RNA, a następnie oczyszczanie są stosunkowo standardowe pod względem procedury i czasu.
Inną cechą, która może być specyficzna dla niektórych zestawów, jest ilość próbki wymaganej do przetworzenia reakcji. Podczas gdy niektóre zestawy izolacyjne mogą wymagać stosunkowo dużej objętości próbki, inne zestawy mogą dobrze działać z mniejszą objętością. Ta różnica może być zaletą, jeśli objętość próbki jest czynnikiem ograniczającym.
Kilku producentów zestawów izolacyjnych RNA ma wykresy porównawcze dostępnych w Internecie. Te wykresy można wykorzystać do zobaczenia różnic między różnymi wytwarzanymi przez nich zestawami. Różnice mogą obejmować wyspecjalizowane typy zastosowań, chemikalia i wymagane objętości próbki.