Jakie są różne typy zestawów do izolacji RNA?
Większość zestawów do izolacji kwasu rybonukleinowego (RNA) może izolować wysokiej jakości RNA z szerokiej gamy tkanek i rodzajów organizmów, w tym roślin, zwierząt i wirusów. Mitochondrialny i rybosomalny RNA - odpowiednio mRNA i rRNA - mogą wymagać specjalnych zestawów do izolacji RNA specyficznych dla małych nici RNA. Inne czynniki, które mogą się różnić w zależności od zestawu do izolacji, to liczba próbek, które każdy zestaw może przetworzyć, oraz czas potrzebny do całkowitego przetworzenia próbki.
Najpopularniejsze typy zestawów do izolacji RNA mogą być używane do wielu różnych zastosowań, niezależnie od tego, skąd pochodzi RNA. Komórki i tkanki ssaków należą do najbardziej dominujących źródeł wykorzystywanych do izolacji i oczyszczania RNA. Komórki roślinne i wirusy są również wykorzystywane w eksperymentach biologii molekularnej, które wymagają użycia zestawu do izolacji RNA.
Po pobraniu próbki tkanki lub krwi należy ją przygotować do izolacji RNA podczas krytycznego procesu zwanego degradacją, separacją lub rozerwaniem komórek. Jeśli materiał komórkowy nie zostanie zakończony, zostanie przerwany, proces izolacji RNA wytworzy mniej RNA. Najlepsze zestawy do izolacji RNA obejmują materiały i materiały do degradacji komórkowej przed izolacją i oczyszczania RNA po izolacji.
W szczególnych przypadkach, w których eksperyment wymaga mRNA lub rRNA, dostępne są specjalne zestawy do izolacji RNA dla szczególnie małych nici RNA. Materiały i materiały zawarte w takim zestawie mogą się różnić pod względem ilości i wielkości. Te zestawy izolacyjne RNA są mniej powszechne niż zestawy wielofunkcyjne RNA i może wystąpić znaczna różnica kosztów.
Wiele typowych zestawów do izolacji RNA zaprojektowano do użytku ze wszystkimi typami tkanek i komórek i mogą one zakończyć reakcję w ciągu około 20 minut. Czas potrzebny do całkowitej degradacji komórek może się różnić w zależności od tego, gdzie w organizmie zebrano komórki. Poza etapem degradacji komórek proces izolacji RNA i późniejsze oczyszczanie są względnie standardowe pod względem procedury i czasu.
Inną cechą, która może być specyficzna dla niektórych zestawów, jest ilość próbki wymagana do przetworzenia reakcji. Podczas gdy niektóre zestawy izolacyjne mogą wymagać stosunkowo dużej objętości próbki, inne zestawy mogą działać dobrze z mniejszą objętością. Ta różnica może być korzystna, jeśli objętość próbki jest czynnikiem ograniczającym.
Kilku producentów zestawów izolacyjnych RNA ma tabele porównawcze dostępne w Internecie. Tych wykresów można użyć, aby zobaczyć różnice między różnymi zestawami, które produkują. Różnice mogą obejmować wyspecjalizowane typy aplikacji, chemikalia i wymagane objętości próbek.