Wat is een retrotransposon?

Transposons zijn stukjes DNA die mobiel zijn, of kunnen naar verschillende plaatsen binnen genetische informatie van een cel gaan. Door naar een nieuwe locatie binnen het genoom van een cel te gaan, kunnen transposons ervoor zorgen dat mutaties optreden, en de hoeveelheid DNA in de cel veranderen. Ze worden ook aangeduid als springgenen en zijn gegroepeerd in twee categorieën die klasse II -transposons en klasse I -transposons zijn, of retrotransposons. Het verschil tussen deze twee klassen heeft te maken met hoe ze bewegen; Een retrotransposon heeft een tweestaps bewegingsproces.

De bewegingsmethode van het DNA-segment is hoe de transposons in elke categorie worden geclassificeerd. Een Klasse II -transposon is een stuk DNA dat van de ene plaats naar de andere gaat. De beweging van een klasse I transposon, of retrotransposon, is veel complexer en omvat twee stappen voor de beweging van het segment van DNA.

De eerste stap voor de beweging van een retrotransposon is het creëren van een segment van RNA door de transcriptioN van een stuk DNA. Het RNA is nu vrij om door het genoom te bewegen, omdat het niet gebonden is aan een dNA -streng DNA. Wanneer het RNA de nieuwe locatie bereikt, maakt een specifiek enzym, reverse transcriptase genoemd, een nieuwe DNA -streng DNA op basis van het RNA -segment. Dit nieuwe stuk DNA wordt vervolgens bevestigd aan de nieuwe locatie in het genoom.

Wanneer een retrotransposon terug wordt getranscribeerd in een DNA -segment uit de RNA -kopie, heeft het meestal lange terminale herhalingen (LTR's) aan het einde van de DNA -sequentie. LTR's bestaan ​​uit het herhalen van reeksen bases die honderden of zelfs duizenden bases lang kunnen zijn. Ze omringen meestal een functioneel deel van het DNA, zoals een gen, en zijn nodig om het DNA -segment aan de oorspronkelijke DNA -streng te bevestigen. LTR's zijn een manier waarop wetenschappers kunnen herkennen dat een deel van DNA een retrotransposon bevat. Er wordt gedacht dat ongeveer 42% van het hele menselijke genoom bestaat uit retrotrANSPOSONS.

Vanwege het feit dat nieuwe kopieën van DNA worden gemaakt door de reverse transcriptie van RNA, is het toevoegen van een retrotransposon een manier om de hoeveelheid DNA in een enkele cel te vergroten. Als een retrotransposon wordt ingebracht in een gen of in de buurt van een gen, kan dit ertoe leiden dat een mutatie optreedt. Mutaties zijn in principe veranderingen in de DNA -sequentie en kunnen een positieve, negatieve of geen invloed hebben op het genoom, afhankelijk van hoe de sequentie van het DNA wordt gewijzigd.

ANDERE TALEN