Qu'est-ce qu'un rétrotransposon?
Les transposons sont des fragments d'ADN mobiles ou pouvant se déplacer à différents endroits au sein des informations génétiques d'une cellule. En se déplaçant vers un nouvel emplacement dans le génome d'une cellule, les transposons peuvent provoquer des mutations et modifier la quantité d'ADN trouvée dans la cellule. Ils sont également appelés gènes sauteurs et sont regroupés en deux catégories: les transposons de classe II et les transposons de classe I, ou rétrotransposons. La différence entre ces deux classes est liée à la manière dont elles se déplacent. un rétrotransposon a un processus de mouvement en deux étapes.
La méthode de déplacement du segment d’ADN est la manière dont les transposons sont classés dans chaque catégorie. Un transposon de classe II est un fragment d’ADN qui se déplace d’un endroit à un autre. Le mouvement d'un transposon de classe I, ou rétrotransposon, est beaucoup plus complexe et comporte deux étapes pour le mouvement du segment d'ADN.
La première étape pour le mouvement d'un rétrotransposon consiste à créer un segment d'ARN par la transcription d'un fragment d'ADN. L'ARN est maintenant libre de se déplacer dans le génome car il n'est pas lié à un brin d'ADN. Lorsque l'ARN atteint le nouvel emplacement, une enzyme spécifique, appelée transcriptase inverse, forme un nouveau brin d'ADN basé sur le segment d'ARN. Ce nouveau fragment d’ADN est ensuite attaché au nouvel emplacement du génome.
Lorsqu'un retrotransposon est retranscrit dans un segment d'ADN à partir de la copie d'ARN, il comporte généralement de longues répétitions terminales (LTR) à la fin de la séquence d'ADN. Les LTR sont constitués de séquences répétitives de bases pouvant atteindre des centaines voire des milliers de bases. Ils entourent généralement une partie fonctionnelle de l'ADN, telle qu'un gène, et sont nécessaires pour attacher le segment d'ADN au brin d'ADN d'origine. Les LTR sont un moyen par lequel les scientifiques peuvent reconnaître qu’une partie de l’ADN contient un rétrotransposon. On pense qu'environ 42% du génome humain est constitué de rétrotransposons.
Du fait que de nouvelles copies de l'ADN sont créées par la transcription inverse de l'ARN, l'ajout d'un rétrotransposon est un moyen d'augmenter la quantité d'ADN trouvée dans une cellule unique. Si un rétrotransposon est inséré dans un gène ou à proximité d'un gène, il peut provoquer une mutation. Les mutations sont fondamentalement des modifications de la séquence d'ADN et peuvent avoir un impact positif, négatif ou nul sur le génome, en fonction de la modification de la séquence de l'ADN.