Hvad er et retrotransposon?
Transposoner er stykker af DNA, der er mobile, eller som kan flytte til forskellige steder inden for genetisk information om en celle. Ved at flytte til et nyt sted inden i en celle genom, kan transposoner forårsage mutationer, samt ændre mængden af DNA, der findes i cellen. De omtales også som hoppegener og grupperes i to kategorier, der er klasse II-transposoner og klasse I-transposoner, eller retrotransposoner. Forskellen mellem disse to klasser har at gøre med, hvordan de bevæger sig; et retrotransposon har en totrins bevægelsesproces.
Metoden til bevægelse af segmentet af DNA er, hvordan transposonerne klassificeres i hver kategori. Et transposon i klasse II er et stykke DNA, der bevæger sig fra et sted til et andet. Bevægelsen af et klasse I-transposon eller retrotransposon er meget mere kompliceret og involverer to trin til bevægelse af DNA-segmentet.
Det første trin til bevægelse af et retrotransposon er at skabe et segment af RNA gennem transkription af et stykke DNA. RNA er nu frit at bevæge sig gennem genomet, da det ikke er bundet til en DNA-streng. Når RNA når den nye placering, fremstiller et specifikt enzym, kaldet revers transkriptase, en ny streng DNA baseret på RNA-segmentet. Dette nye stykke DNA er derefter knyttet til den nye placering i genomet.
Når et retrotransposon transkriberes tilbage til et DNA-segment fra RNA-kopien, har det normalt lange terminale gentagelser (LTR'er) i slutningen af DNA-sekvensen. LTR'er består af gentagne sekvenser af baser, der kan være hundreder eller endda tusinder af baser lange. De omgiver normalt en funktionel del af DNA'et, såsom et gen, og er nødvendige for at fastgøre DNA-segmentet til den originale DNA-streng. LTR'er er en måde, hvorpå forskere kan erkende, at en del af DNA indeholder et retrotransposon. Det menes, at ca. 42% af hele det humane genom består af retrotransposoner.
På grund af det faktum, at nye kopier af DNA laves gennem omvendt transkription af RNA, er tilføjelse af et retrotransposon en måde at øge mængden af DNA, der findes inden for en enkelt celle. Hvis et retrotransposon indsættes i et gen eller i nærheden af et gen, kan det forårsage en mutation. Mutationer er dybest set ændringer i DNA-sekvensen og kan have positiv, negativ eller ingen indflydelse på genomet, afhængigt af hvordan DNA-sekvensen ændres.