Co je to Retrotransposon?
Transpozony jsou kousky DNA, které jsou mobilní nebo se mohou pohybovat na různých místech v rámci genetických informací o buňce. Přesunem na nové místo v genomu buňky mohou transpozony způsobit mutace a také změnit množství DNA nalezené v buňce. Oni jsou také odkazoval se na jako skoky geny, a být seskupen do dvou kategorií, které jsou transpozony třídy II a transpozony třídy I, nebo retrotransposons. Rozdíl mezi těmito dvěma třídami souvisí s tím, jak se pohybují; retrotransposon má dvoustupňový proces pohybu.
Metoda pohybu segmentu DNA je způsob, jakým jsou transpozony klasifikovány do každé kategorie. Transponon třídy II je část DNA, která se pohybuje z jednoho místa na druhé. Pohyb transposonu třídy I nebo retrotransposonu je mnohem složitější a zahrnuje dva kroky pro pohyb segmentu DNA.
Prvním krokem pro pohyb retrotransposonu je vytvoření segmentu RNA transkripcí části DNA. RNA se nyní může volně pohybovat v genomu, protože není vázána na řetězec DNA. Když RNA dosáhne nového umístění, vytvoří specifický enzym zvaný reverzní transkriptáza nový řetězec DNA založený na segmentu RNA. Tato nová část DNA je poté připojena k novému umístění v genomu.
Když je retrotransposon přepisován zpět do segmentu DNA z kopie RNA, má obvykle na konci sekvence DNA dlouhé terminální repetice (LTR). LTR jsou tvořeny opakujícími se sekvencemi bází, které mohou být dlouhé stovky nebo dokonce tisíce bází. Obvykle obklopují funkční část DNA, jako je gen, a jsou nezbytné pro připojení segmentu DNA k původnímu řetězci DNA. LTR jsou jedním ze způsobů, který vědci uznávají, že část DNA obsahuje retrotransposon. Předpokládá se, že asi 42% celého lidského genomu je tvořeno retrotranspozony.
Vzhledem k tomu, že nové kopie DNA jsou vytvářeny reverzní transkripcí RNA, je přidání retrotransposonu způsob, jak zvýšit množství DNA nalezené v jedné buňce. Pokud je retrotransposon vložen do genu nebo blízko genu, může to způsobit mutaci. Mutace jsou v zásadě změny sekvence DNA a mohou mít pozitivní, negativní nebo žádný dopad na genom, v závislosti na tom, jak se mění sekvence DNA.