Co je to retrotransposon?
Transpozony jsou kousky DNA, které jsou mobilní, nebo se mohou pohybovat na různá místa v rámci genetické informace o buňce. Přesunutím na nové místo v genomu buňky mohou transpozony způsobit, že dojde k mutacím, a také změnit množství DNA nalezené v buňce. Jsou také označovány jako skákající geny a jsou seskupeny do dvou kategorií, které jsou transpozony třídy II a transpozony třídy I nebo retrotransposony. Rozdíl mezi těmito dvěma třídami souvisí s tím, jak se pohybují; Retrotransposon má dvoustupňový pohybový proces.
Způsob pohybu segmentu DNA je způsob, jakým jsou transpozony klasifikovány do každé kategorie. Transposon třídy II je kus DNA, která se pohybuje z jednoho místa na druhé. Pohyb třídy I Transposon nebo Retrotransposon je mnohem složitější a zahrnuje dva kroky pro pohyb segmentu DNA.n kusu DNA. RNA se nyní může volně pohybovat po celém genomu, protože není vázána na pramen DNA. Když RNA dosáhne nového umístění, specifický enzym, nazývaný reverzní transkriptáza, vytvoří nový pramen DNA založený na segmentu RNA. Tento nový kus DNA je poté připojen k novému umístění v genomu.
Když je retrotransposon přepsán zpět do segmentu DNA z kopie RNA, má obvykle na konci sekvence DNA dlouhé terminální opakování (LTR). LTR jsou tvořeny opakujícími se sekvencemi základů, které mohou být dlouhé stovky nebo dokonce tisíce základů. Obvykle obklopují funkční část DNA, jako je gen, a jsou nezbytné pro připojení segmentu DNA k původnímu řetězci DNA. LTR jsou jedním ze způsobů, jak vědci mohou rozpoznat, že část DNA obsahuje retrotransposon. Předpokládá se, že asi 42% celého lidského genomu je tvořeno retrotremAnsposons.
Vzhledem k tomu, že nové kopie DNA se provádějí prostřednictvím reverzní transkripce RNA, přidání retrotransposonu je způsob, jak zvýšit množství DNA nalezené v jedné buňce. Pokud je retrotransposon vložen do genu nebo v blízkosti genu, může způsobit, že dojde k mutaci. Mutace jsou v podstatě změny v sekvenci DNA a mohou mít pozitivní, negativní nebo žádný dopad na genom, v závislosti na tom, jak se mění sekvence DNA.