Cos'è un retrotrasposon?
I trasposoni sono pezzi di DNA che sono mobili o possono spostarsi in diversi luoghi all'interno di informazioni genetiche di una cellula. Passando in una nuova posizione all'interno del genoma di una cellula, i trasposoni possono causare mutazioni, oltre a cambiare la quantità di DNA trovata all'interno della cellula. Sono anche indicati come geni di salto e sono raggruppati in due categorie che sono trasposoni di classe II e trasposoni di classe I o retrotrasposoni. La differenza tra queste due classi ha a che fare con il modo in cui si muovono; Un retrotrasposon ha un processo di movimento in due fasi.
Il metodo di movimento del segmento del DNA è il modo in cui i trasposoni vengono classificati in ciascuna categoria. Un trasposone di classe II è un pezzo di DNA che si sposta da un posto all'altro. Il movimento di un trasposone di classe I, o retrotrasposone, è molto più complesso e coinvolge due passaggi per il movimento del segmento del DNA.
Il primo passo per il movimento di un retrotrasposon è creare un segmento di RNA attraverso il trascrittoreN di un pezzo di DNA. L'RNA è ora libero di muoversi in tutto il genoma in quanto non è legato a un filo di DNA. Quando l'RNA raggiunge la nuova posizione, un enzima specifico, chiamato trascrittasi inverso, crea un nuovo filone di DNA basato sul segmento dell'RNA. Questo nuovo pezzo di DNA viene quindi attaccato alla nuova posizione all'interno del genoma.
Quando un retrotrasposone viene trascritto di nuovo in un segmento DNA dalla copia dell'RNA, di solito ha ripetizioni terminali lunghe (LTR) alla fine della sequenza del DNA. Gli LTR sono costituiti da sequenze ripetute di basi che possono essere lunghe centinaia o addirittura migliaia di basi. Di solito circondano una parte funzionale del DNA, come un gene, e sono necessari per attaccare il segmento del DNA al filamento originale del DNA. Gli LTR sono un modo in cui gli scienziati possono riconoscere che una sezione di DNA contiene un retrotrasposone. Si pensa che circa il 42% dell'intero genoma umano sia composto da retrotrAnsposons.
A causa del fatto che le nuove copie del DNA vengono realizzate attraverso la trascrizione inversa dell'RNA, l'aggiunta di un retrotrasposone è un modo per aumentare la quantità di DNA trovata all'interno di una singola cellula. Se un retrotrasposone viene inserito all'interno di un gene o vicino a un gene, allora può causare una mutazione. Le mutazioni sono sostanzialmente cambiamenti nella sequenza del DNA e possono avere un impatto positivo, negativo o nullo sul genoma, a seconda di come viene alterata la sequenza del DNA.