Hva er en exopeptidase?

Innenfor fordøyelsessystemet er det mange forskjellige enzymer som bryter ned matmolekyler. Hver av disse enzymene har en annen rolle, og noen fungerer bare i et spesifikt organ under spesifikke forhold. Mest fordøyelse foregår i tynntarmen av et stort antall forskjellige enzymer. Fordøyelsen av proteiner er et eksempel på en kompleks prosess som utføres i forskjellige organer av forskjellige grupper av enzymer. Exopeptidaser er en gruppe enzymer som er involvert i fullstendig fordøyelse av proteiner.

Fordøyelsen av et proteinmolekyl er veldig spesifikt, ettersom enzymene som er involvert bare bryter bindingene ved siden av visse aminosyrer som finnes i peptidkjeden. Når en peptidbinding dannes, er den alltid mellom aminosiden av en aminosyre og karboksylenden av en annen. Når aminosyresekvensen er gitt for en spesiell peptidkjede, eller protein, leses den vanligvis fra aminosiden, N-terminalen, til den siste aminosyren, som har en fri karboksyl, eller C-terminalen. Til å begynne med, selv om proteinet brytes ned, produseres svært få aminosyrer.

Proteiner er store molekyler, og fordøyelsen deres har en rekke trinn, begynner i magen av pepsin, en av tre endopeptidaser. Når de delvis fordøyede proteinene beveger seg fra magen til tynntarmen, fortsetter de to andre endopeptidaseene, trypsin og chymotrypsin, å bryte ned proteinene. Disse tre enzymene deler de lange peptidstrengene som utgjør proteinet i forskjellige lengder. Endopeptidaser er så navngitt som de bryter ned peptidbindingen som finnes i proteinet.

For å fullføre fordøyelsesprosessen for å produsere enkle aminosyrer fra en proteinkjede, er en exopeptidase nødvendig. Hver exopeptidase bryter bindingen mellom den endelige aminosyren og resten av kjeden. Det er flere forskjellige exopeptidaser, som hver har en meget spesifikk virkemåte. Hvor aminosyren er bundet til resten av peptidkjeden og hvilke aminosyrer som er bundet sammen, spiller en rolle i å bestemme hvilken eksopeptidase som vil bryte bindingen.

Karboksypeptidase er en exopeptidase som bryter bindingen mellom den nest siste og den siste aminosyren ved C-terminalen. En annen exopeptidase, aminopeptidase, utfører den samme handlingen, men ved N-terminalen. Andre exopeptidaser, kalt dipeptidaser, bryter fra hverandre bestemte par aminosyrer. For eksempel vil en dipeptidase bare bryte bindingen mellom et glysin knyttet til et leucin. En annen dipeptidase vil bare virke på en peptidbinding mellom to glycinaminosyrer som er koblet sammen.