Hvad er en exopeptidase?
I fordøjelsessystemet er der mange forskellige enzymer, der nedbryder madmolekyler. Hver af disse enzymer har en anden rolle, og nogle fungerer kun i et specifikt organ under specifikke betingelser. Mest fordøjelse finder sted inden i tyndtarmen af et stort antal forskellige enzymer. Fordøjelsen af proteiner er et eksempel på en kompleks proces, der udføres i forskellige organer af forskellige grupper af enzymer. Exopeptidaser er en gruppe enzymer, der er involveret i fuldstændig fordøjelse af proteiner.
Fordøjelsen af et proteinmolekyle er meget specifik, da de involverede enzymer kun bryder bindingerne ved siden af visse aminosyrer, der findes i peptidkæden. Når der dannes en peptidbinding, er det altid mellem aminosyren af en aminosyre og carboxylenden af en anden. Når aminosyresekvensen gives for en bestemt peptidkæde eller protein, læses den sædvanligvis fra aminosiden, N-terminalen, til den sidste aminosyre, der har en fri carboxyl eller C-terminalen. Oprindeligt, selv om proteinet nedbrydes, produceres meget få aminosyrer.
Proteiner er store molekyler, og deres fordøjelse har et antal trin, der begynder i maven med pepsin, en af tre endopeptidaser. Når de delvist fordøjede proteiner bevæger sig fra maven til tyndtarmen, fortsætter de to andre endopeptidaser, trypsin og chymotrypsin, med at nedbryde proteinerne. Disse tre enzymer opdeler de lange peptidstrenge, der udgør proteinet i forskellige længder. Endopeptidaser benævnes så, da de nedbryder de peptidbindinger, der findes i proteinet.
For at afslutte fordøjelsesprocessen til fremstilling af enkelte aminosyrer fra en proteinkæde er der behov for en exopeptidase. Hver exopeptidase bryder bindingen mellem den endelige aminosyre og resten af kæden. Der er adskillige forskellige exopeptidaser, som hver har en meget specifik virkemåde. Hvor aminosyren er forbundet til resten af peptidkæden, og hvilke aminosyrer der er forbundet, spiller en rolle i bestemmelsen af, hvilken exopeptidase der vil bryde bindingen.
Carboxypeptidase er en exopeptidase, der bryder bindingen mellem den næstsidste og den sidste aminosyre ved C-terminale ende. En anden exopeptidase, aminopeptidase, udfører den samme handling, men i den N terminale ende. Andre exopeptidaser, kaldet dipeptidaser, bryder bestemte par aminosyrer fra hinanden. For eksempel vil en dipeptidase kun bryde bindingen mellem en glycin bundet med en leucin. En anden dipeptidase vil kun virke på en peptidbinding mellem to glycinaminosyrer bundet sammen.