Co to jest egzopeptydaza?
W układzie pokarmowym istnieje wiele różnych enzymów, które rozkładają molekuły żywności. Każdy z tych enzymów ma inną rolę, a niektóre działają tylko w określonym organie w określonych warunkach. Większość trawienia odbywa się w jelicie cienkim przez dużą liczbę różnych enzymów. Trawienie białek jest przykładem złożonego procesu przeprowadzanego w różnych narządach przez różne grupy enzymów. Egzopeptydazy to jedna grupa enzymów biorących udział w całkowitym trawieniu białek.
Trawienie cząsteczki białka jest bardzo specyficzne, ponieważ zaangażowane enzymy tylko przerywają wiązania poza pewnymi aminokwasami znajdującymi się w łańcuchu peptydowym. Kiedy powstaje wiązanie peptydowe, zawsze znajduje się ono między końcem aminowym jednego aminokwasu a końcem karboksylowym drugiego. Gdy sekwencja aminokwasowa jest podana dla konkretnego łańcucha peptydowego lub białka, jest ona zwykle odczytywana od końca aminowego, N-końca, do ostatniego aminokwasu, który ma wolny karboksyl lub C-koniec. Początkowo, chociaż białko jest rozkładane, wytwarzanych jest bardzo niewiele aminokwasów.
Białka są dużymi cząsteczkami, a ich trawienie przebiega w kilku etapach, zaczynając od żołądka przez pepsynę, jedną z trzech endopeptydaz. Gdy częściowo strawione białka przemieszczą się z żołądka do jelita cienkiego, pozostałe dwie endopeptydazy, trypsyna i chymotrypsyna, nadal rozkładają białka. Te trzy enzymy dzielą długie nici peptydowe, które tworzą białko na różne długości. Endopeptydazy są tak nazwane, ponieważ rozkładają wiązania peptydowe znajdujące się w białku.
Aby zakończyć proces trawienia w celu wytworzenia pojedynczych aminokwasów z łańcucha białkowego, potrzebna jest egzopeptydaza. Każda egzopeptydaza zrywa wiązanie między końcowym aminokwasem a resztą łańcucha. Istnieje kilka różnych egzopeptydaz, z których każda ma wysoce specyficzny mechanizm działania. Gdzie aminokwas jest połączony z resztą łańcucha peptydowego i które aminokwasy są ze sobą połączone, odgrywa rolę w określaniu, która egzopeptydaza zrywa wiązanie.
Karboksypeptydaza jest egzopeptydazą, która przerywa wiązanie między drugim i ostatnim aminokwasem na końcu C-końcowym. Inna egzopeptydaza, aminopeptydaza, wykonuje to samo działanie, ale na końcu N. Inne egzopeptydazy, zwane dipeptydazami, rozkładają poszczególne pary aminokwasów. Na przykład, jedna dipeptydaza zrywa tylko wiązanie między glicyną połączoną z leucyną. Inna dipeptydaza działa tylko na wiązanie peptydowe między dwoma połączonymi ze sobą aminokwasami glicyny.