Co je to exopeptidáza?
V trávicím systému existuje mnoho různých enzymů, které rozkládají molekuly potravin. Každý z těchto enzymů má odlišnou roli a některé působí pouze v konkrétním orgánu za specifických podmínek. Většina trávení probíhá v tenkém střevě velkým počtem různých enzymů. Digesce proteinů je příkladem komplexního procesu, který je prováděn v různých orgánech různými skupinami enzymů. Exopeptidázy jsou jednou skupinou enzymů zapojených do úplného trávení proteinů. Když se vytvoří peptidová vazba, je vždy mezi amino konec jedné aminokyseliny a karboxylovým koncem druhé. Když je aminokyselinová sekvence podávána pro konkrétní peptidový řetězec nebo protein, obvykle se čte z aminového konce, n terminálu, do poslední aminokyseliny, která má volný karboxyl nebo C termina cl. Zpočátku, i když se protein rozkládá, se produkuje jen velmi málo aminokyselin.
proteiny jsou velké molekuly a jejich trávení má řadu kroků, počínaje žaludkem Pepsinem, jednou ze tří endopeptidáz. Jakmile se částečně štěpené proteiny přesunou ze žaludku do tenkého střeva, další dvě endopeptidázy, trypsin a chymotrypsin, nadále rozkládají proteiny. Tyto tři enzymy rozdělily dlouhé peptidové prameny, které tvoří protein na různé délky. Endopeptidázy jsou tak pojmenovány, protože rozkládají peptidové vazby nalezené v proteinu.
Pro dokončení trávicího procesu pro výrobu jednotlivých aminokyselin z proteinového řetězce je zapotřebí exopeptidázy. Každá exopeptidáza narušuje vazbu mezi koncovou aminokyselinou a zbytkem řetězce. Existuje několik různých exopeptidáz, z nichž každá má vysoce specifický způsob účinku. KdeAminokyselina je spojena se zbytkem peptidového řetězce a které aminokyseliny jsou spojeny dohromady hrají roli při určování toho, která exopeptidáza přeruší vazbu.
karboxypeptidáza je exopeptidáza, která rozbije vazbu mezi druhým posledním a posledním aminokyselinou na konci C. Další exopeptidáza, aminopeptidáza, provádí stejnou akci, ale na konci terminálu N. Jiné exopeptidázy, zvané dipeptidázy, rozkládají konkrétní páry aminokyselin. Například jedna dipeptidáza rozbije pouze vazbu mezi glycinem spojeným s leucinem. Další dipeptidáza bude působit pouze na peptidovou vazbu mezi dvěma glycinovými aminokyselinami spojenými dohromady.