Hva er Western blot?

En western blot er en laboratorieanalyseteknikk som brukes til å isolere proteiner. Det kan brukes i diagnostisering av visse sykdommer, og også i forskning på forskjellige proteiner og prosesser. Familiemessig er den vestlige flekken knyttet til diagnose av HIV-infeksjon, men den kan også brukes til å lete etter spor etter bovin spongiform encefalitt (BSE) og Lyme sykdom. Prøver som sendes ut for testing med en Western blot-protokoll, kan gi resultater i løpet av noen dager til flere uker, avhengig av laboratoriekapasitet og presserende hastighet.

I en western blot blir prøven, som kan være fra blod eller vev, først satt gjennom elektroforese slik at proteinene skilles ut etter lengde. En stripe av elektroforesegelen med isolerte proteiner med mållengden kan brukes til å overføre proteinene til et nitrocellulosesubstrat for neste trinn av testen. I løpet av dette stadiet introduseres et antistoff i prøven, med målet å merke proteiner med antigener som antistoffet låser seg fast på.

Når proteinene er merket, kan de lett identifiseres. Når det gjelder testing for sykdom, indikerer tilstedeværelsen av et reaktivt protein at prøven har testet positivt. Western blots returnerer sjelden falske positiver, selv om det kan skje av og til, og de kan også returnere falske negativer der en person faktisk har en sykdom, men det vises ikke ved western blot-testing. Dette kan være spesielt vanlig i tilfeller der det sykdomsfremkallende middelet ennå ikke har begynt å replikere.

Forskere kan bruke resultatene til å identifisere spesifikke proteiner som de sporer, og til en rekke andre formål. Å forstå hvordan western blot-protokollen fungerer er en viktig ferdighet for noen forskere og laboratorieteknikere, da de må kunne gi pålitelige og pålitelige resultater ved bruk av denne metoden. Lab-ferdigheter, inkludert å lære å håndtere kompliserte eller dårlige prøver, og hvordan man kan unngå forurensning under prosessen slik at resultatene av testen er kjent for å være sanne.

Denne teknikken er noen ganger kjent som en immunoblot, fordi egentlig de ønskede proteiner "blottes" med antistoffer, slik at de dukker opp. Denne testen kan brukes til å lete etter proteiner hos alle dyr, ikke bare mennesker, med veterinærer som ofte bruker western blot-testen for å bestemme om en flokk med kyr har blitt infisert eller utsatt for BSE eller ikke.