Co je to marker molekulové hmotnosti?
Marker molekulové hmotnosti je molekula používaná k poskytnutí odhadu velikosti molekul podrobených gelové elektroforéze. Toto je technika, ve které jsou DNA, RNA nebo proteiny odděleny velikostí pomocí elektrického proudu na gelu. Tento termín by neměl být zaměňován s molekulárními markery v genetice - oblasti, ve kterých se DNA organismu liší od zbytku populace a může být identifikována sondou DNA. Marker molekulové hmotnosti je skupinou proteinů známé molekulové hmotnosti, které jsou obecně poskytovány biotechnologickými společnostmi v určitém rozsahu velikosti. Jeden si vybere rozsah velikosti na základě studovaných vzorků. Značky molekulové hmotnosti jsou naloženy dohromady a během běhu oddělují. Měřením vzdálenosti ujetého markery a proteinem, který je zajímavý, lze určit velikost experimentálního proteinu.
Různé tyPES značek lze vizualizovat různými způsoby. Některé z molekulárních markerů jsou neznačeny a jsou obarveny v gelu se zbytkem proteinů. Nejsou viditelné, dokud není obarven celý gel. Jiné typy molekulárních markerů proteinů jsou předem obarveny barvami a každý typ proteinu je jiná barva. Separace je viditelné, když je gel spuštěn.
Jednou z výhod předem zbarveného markeru molekulové hmotnosti je pro západní bloty. Jedná se o techniku, ve které jsou proteiny přenášeny na membránu a poté obarveny protilátkami pro detekci konkrétního proteinu. Pomocí barevných značek pomáhá určit, zda je přenos proteinů dokončen před tím, než jeden postupuje se zbytkem postupu.
Markery molekulové hmotnosti se běžně používají pro analýzu DNA na gelech. Molekulární markery DNA jsou často vyrobeny z bakteriálního viru lambda . Omezení enzyME jsou vyráběny bakteriemi pro trávení DNA invazivních organismů a restrikční enzym hindiii se často používá k degradaci Lambda DNA. Vytváří řadu různých, reprodukovatelných fragmentů známých jako DNA žebřík . Porovnáním vzdálenosti provozované podle standardů v logaritmickém měřítku lze určit velikost analyzovaných fragmentů DNA.
Tento marker molekulové hmotnosti DNA lze použít k analýze velikosti DNA produkované během izolace genů a v experimentech s genetickým inženýrstvím. Může být také použit během polymerázové řetězové reakce (PCR), ve kterém se amplifikována malá množství DNA nebo RNA za vzniku velkého množství produktu. Techniky PCR jsou běžně spojeny s testováním otcovství a forenzní vědou, ale jsou také velmi běžné v lékařském a základním biologickém výzkumu. Speciální markery molekulové hmotnosti jsou k dispozici pro menší produkty generované z některých typů PCR nebo malých molekul RNA.