Co je anotace genomu?
Anotace genomu označuje sekce genomu s informacemi o genetických datech, které obsahuje. Toto je součást procesu na projektech genomu, kde cílem není pouze sekvence DNA cílového organismu, ale také pochopit, co dělá a jak funguje. Vědci mohou ve svých laboratořích provádět anotaci a mohou sdílet data s ostatními vědci, aby sdružili zdroje a informace. K dispozici jsou online databáze otevřené veřejnosti a některé také umožňují členům veřejnosti předložit své vlastní anotace. Sekvenování celého genomu trvá dlouho a je běžné, že vědci zahájí anotaci před dekódováním genomu. S částí sekvenované DNA v ruce může výzkumník začít anotovat. Vědci si mohou všimnout, kde se zdá, že geny začínají a zastavují, a věnují pozornost výrazným řetězcům DNA, které obsahují informaceo funkci genomu.
počítače jsou schopny provádět určitou anotaci genomu samy o sobě. Mohou hledat známé vzorce, jako jsou řetězce aminokyselin, které se objevují na začátku a na konci genů. V automatizované anotaci může počítač přidat poznámky do různých částí řetězce DNA, aby o něm poskytl informace. Je také možné porovnat segmenty z různých organismů a hledat rozptyl, které by mohly poskytnout důležité informace o druhu jako celku.
Manuální anotace genomu zahrnuje fyzickou kontrolu DNA. Mnoho vědců používá počítače k zobrazení informací a označení je, což jim umožňuje zadat do databází, jak fungují. V některých případech může být po automatizované anotaci nezbytná ruční kontrola, aby se zajistilo, že počítač má informace o správném stavu. Může to být pečlivý proces a dochází k chybám, což je jeden z důvodů opakováníChers rád balíky balíčků. Pokud anotace neodpovídá ostatním ve stejné části DNA, mohou lidé vyhodnotit informace, aby určili, co se stalo, a opravit chybu.
Není vždy možné určit, co gen dělá během procesu anotace genomu. Vědci mohou označit geny a oddělit je od jiných složek genomu, jako jsou nekódující DNA, jako jsou opakování. Tyto informace lze použít ve výzkumu, protože lidé vyvíjejí teorie o různých segmentech genomu. Mohou přidat k anotacím, aby si všimli funkce genu.