O que é anotação de genoma?
A anotação de genoma marca as seções de um genoma com informações sobre os dados genéticos que ele contém. Isso faz parte do processo em projetos de genoma, onde o objetivo não é apenas sequenciar o DNA de um organismo alvo, mas entender o que ele faz e como funciona. Os pesquisadores podem realizar anotações em seus laboratórios e compartilhar dados com outros cientistas para reunir recursos e informações. Os bancos de dados online abertos ao público estão disponíveis, e alguns também permitem que os membros do público em geral enviem suas próprias anotações.
O primeiro passo na anotação do genoma é o sequenciamento, em que os pesquisadores determinam a ordem dos aminoácidos no DNA de um organismo. A sequência de um genoma inteiro leva muito tempo e é comum os cientistas começarem a fazer anotações antes que o genoma tenha sido decodificado. Com uma seção de DNA seqüenciado em mãos, um pesquisador pode começar a fazer anotações. Os cientistas podem observar onde os genes parecem começar e parar, prestando atenção às seqüências distintas de DNA que contêm informações sobre a função do genoma.
Os computadores são capazes de realizar anotações do genoma por conta própria. Eles podem buscar padrões conhecidos, como cadeias de aminoácidos que aparecem no início e no final dos genes. Na anotação automatizada, o computador pode adicionar notas a diferentes seções de uma cadeia de DNA para fornecer informações sobre ela. Também é possível comparar segmentos de diferentes organismos para procurar variações que possam fornecer informações importantes sobre a espécie como um todo.
A anotação manual do genoma envolve a revisão física do DNA. Muitos pesquisadores usam computadores para exibir as informações e identificá-las, permitindo que elas sejam inseridas nos bancos de dados enquanto trabalham. Em alguns casos, uma revisão manual pode ser necessária após a anotação automática, para garantir que o computador tenha as informações corretas. Esse pode ser um processo minucioso e ocorrem erros, razão pela qual os pesquisadores gostam de agrupar bancos de dados. Se uma anotação não corresponder a outras na mesma seção do DNA, as pessoas poderão avaliar as informações para determinar o que aconteceu e corrigir o erro.
Nem sempre é possível determinar o que um gene faz durante o processo de anotação do genoma. Os cientistas podem sinalizar genes e separá-los de outros componentes do genoma, como DNA não codificante, como repetições. Essa informação pode ser usada em pesquisas à medida que as pessoas desenvolvem teorias sobre diferentes segmentos do genoma. Eles podem adicionar às anotações para observar a função de um gene.