Hvad er genomkommentarer?
Genomarkering mærker dele af et genom med information om de genetiske data, det indeholder. Dette er en del af processen ved genomprojekter, hvor målet ikke kun er at sekvensere en målorganismes DNA, men at forstå, hvad den gør, og hvordan den fungerer. Forskere kan foretage kommentarer i deres laboratorier og kan dele data med andre forskere for at samle ressourcer og information. Onlinedatabaser, der er åbne for offentligheden, er tilgængelige, og nogle tillader også offentlighedens medlemmer at indsende deres egne kommentarer.
Det første trin i genom-annotation er sekventering, hvor forskere bestemmer rækkefølgen af aminosyrer i en organisms DNA. Det tager lang tid at sekventere et helt genom, og det er almindeligt, at forskere begynder at kommentere, før genomet er dekodet. Med et afsnit af sekventeret DNA i hånden kan en forsker begynde at kommentere. Forskere kan bemærke, hvor gener ser ud til at starte og stoppe, og være opmærksomme på karakteristiske strenge af DNA, der indeholder information om genomets funktion.
Computere er i stand til at udføre nogle genomkommentarer alene. De kan søge kendte mønstre, såsom strenge af aminosyrer, der vises i begyndelsen og slutningen af gener. I automatiseret annotering kan computeren tilføje noter til forskellige sektioner i en DNA-streng for at give information om det. Det er også muligt at sammenligne segmenter fra forskellige organismer for at se efter varians, der kan give vigtige oplysninger om arten som helhed.
Manuel genomkommentation involverer fysisk gennemgang af DNA'et. Mange forskere bruger computere til at vise oplysningerne og mærke dem, så de kan indtaste dem i databaser, mens de fungerer. I nogle tilfælde kan en manuel gennemgang være nødvendig efter en automatisk annotering for at sikre, at computeren har oplysningerne korrekte. Dette kan være en omhyggelig proces, og der opstår fejl, hvilket er en af grundene til, at forskere kan samle databaser. Hvis en kommentar ikke matcher andre på den samme sektion af DNA, kan folk evaluere oplysningerne for at bestemme, hvad der skete, og rette fejlen.
Det er ikke altid muligt at bestemme, hvad et gen gør under genom-annotationsprocessen. Forskere kan markere gener og adskille dem fra andre komponenter i genomet, såsom ikke-kodende DNA som gentagelser. Denne information kan bruges i forskning, når mennesker udvikler teorier om forskellige segmenter af genomet. De kan tilføje kommentarerne for at bemærke et gens funktion.