Hvad er bioinformatisk analyse?
"Bioinformatisk analyse" er et udtryk, der bruges til at beskrive en række teknikker, der bruger edb-systemer til at indsamle og analysere store organer af biologiske data. Bioinformatik er en tværfaglig tilgang til biologiske problemer og involverer ofte omfattende brug af datalogi og matematik ud over de traditionelle biologi og kemi-fremgangsmåder, der ofte bruges til at konfrontere biologiske problemer. Mange af de centrale teknikker i bioinformatisk analyse er baseret på statistikker. De involverer indsamling af et stort antal data, generelt fra mange eksperimenter og undertiden fra mange forskellige laboratorier, og på udkig efter statistiske tendenser og betydelige sammenhænge. Anvendelser af bioinformatisk analyse inkluderer DNA-sekvensanalyse, genekspression og reguleringsanalyse og sammenligninger af genomer fra forskellige organismer.
Mange forskellige teknikker bruges i bioinformatisk analyse baseret på de særlige biologiske problemer, der skal løses. I nogle tilfælde involverer bioinformatik blot indsamling af store organer af information i en enkelt database og kørsel af grundlæggende statistiske analyser af de indsamlede data. Andre involverer meget mere nuanceret manipulation af indsamlet information og kan involvere komplekse, matematisk involverede computerprogrammer. Den eneste ting, de fleste metoder inden for bioinformatik har til fælles, er, at de involverer indsamling, manipulation og analyse af store organer af information indsamlet under eksperimenter.
En af de vigtigste anvendelser af bioinformatisk analyse er analyse af sekvenser af strenge af deoxyribonukleinsyre (DNA). DNA-molekyler indeholder den genetiske kode, der styrer strukturen og funktionen af alle organismer. Mens der blev anvendt tidlige manuelle sekvensbestemmelsesmetoder, var de meget langsomme og helt umulige for storskala sekventeringsprojekter. Bioinformatikanalyseteknologi giver mulighed for meget hurtig sekventering, der er mange gange hurtigere end manuel sekventering og er velegnet til store projekter. DNA-sekventering såvel som ribonukleinsyre (RNA) sekventering og proteinsekvensering kan bruges til at forbinde forskellige strukturer og funktioner til deres genetiske koder, til at identificere mutationer og til at sammenligne genomerne fra forskellige organismer.
Automation er et af hovedmålene med bioinformatikanalyse. Der er mange forskellige situationer inden for biologisk og biomedicinsk forskning, der involverer analyse af store organer af information. Selvom det normalt er muligt at analysere disse oplysninger manuelt, er der ofte så meget information, at et enkelt laboratorium kunne arbejde i uger eller længere for at give mening om relativt små informationsmasser. Bioinformatisk analyse kan bruges til at analysere informationen, så forskerne kan bruge deres tid på at generere flere data. Evnen til at analysere flere data kan resultere i mere nøjagtige, overbevisende og betydningsfulde oplysninger.