Cos'è una sequenza peptidica?
I peptidi sono polimeri biologici formati dal collegamento degli aminoacidi, i cui elementi chiave sono carbonio (C), idrogeno (H), ossigeno (O) e azoto (N). Il termine "sequenza peptidica" si riferisce all'ordine in cui gli aminoacidi sono collegati. I peptidi sono molto importanti nei sistemi viventi e si combinano per formare catene molto più grandi chiamate proteine. Sebbene ci siano molte varietà di peptidi biologici, la maggior parte di questi sono costituiti da soli 20 aminoacidi. Le proteine eseguono una gamma di funzioni biologiche, inclusi gli enzimi e nella struttura delle pareti cellulari nelle piante e nelle membrane nelle cellule animali.
Gli aminoacidi sono così chiamati perché hanno amina (-nh 2 ) e gruppi di acido carbossilico (-co 2 . La maggior parte degli aminoacidi presenti nei sistemi biologici ha la formula generale R-CH (NH 2 )-CO 2 H, dove R è una gamma di gruppi. La struttura variabile di R è ciò che influenza la struttura e le proprietà dei peptidi e delle proteine.
La sintesi del peptide si verifica wh whIl gruppo di amine di un aminoacido reagisce con il gruppo di acido carbossilico su un altro aminoacido. Il risultato è la formazione di un gruppo ammidico di struttura -n (h) -co- in cui il legame azoto-carbonio è chiamato legame peptidico. La reazione può aver luogo un numero qualsiasi di volte per formare una sequenza peptidica di diversi gruppi funzionali, ognuno dei quali è intervallato da un gruppo ammide.
peptidi e proteine hanno diversi livelli di struttura. La struttura proteica primaria è l'ordine in cui si trovano gli aminoacidi; Questa è la sua sequenza peptidica. I gruppi funzionali sulla proteina interagiscono tra loro per attirarlo in una forma. I singoli colpi di scena di un peptide sono chiamati la sua struttura secondaria. La sua forma generale, il risultato netto di tutti questi colpi di scena, è la struttura terziaria del peptide.
Le proprietà biochimiche di proteine o peptidi dipendono dalla struttura terziaria. COMECon tutte le sostanze chimiche, le proteine assumeranno la forma più energicamente favorevole. Questa forma è dovuta a forze attraenti e repulsive tra i gruppi sui singoli aminoacidi. Pertanto, la struttura terziaria è dovuta alla struttura primaria, il che significa che dedurre la sequenza peptidica di una particolare proteina spiegherà alla fine le sue proprietà.
Elaborare la sequenza peptidica di una proteina ha applicazioni nella progettazione di prodotti farmaceutici. Molti processi biologici dipendono dalle azioni delle proteine e i farmaci spesso funzionano copiando o bloccando l'azione di queste proteine. Comprendere il comportamento delle proteine potrebbe portare alla progettazione di farmaci più efficaci. Per questo motivo, il dipartimento di ricerca e sviluppo di un'azienda farmaceutica ha in genere una biblioteca peptidica o un catalogo peptidico che utilizzerà nella ricerca di nuovi farmaci.