O que é uma sequência peptídica?
Os peptídeos são polímeros biológicos formados pela ligação de aminoácidos, cujos principais elementos são carbono (C), hidrogênio (H), oxigênio (O) e nitrogênio (N). O termo "sequência peptídica" refere-se à ordem na qual os aminoácidos estão ligados. Os peptídeos são muito importantes nos sistemas vivos e se combinam para formar cadeias muito maiores chamadas proteínas. Embora existam muitas variedades de peptídeos biológicos, a maioria deles é composta de apenas 20 aminoácidos. As proteínas desempenham uma série de funções biológicas, inclusive como enzimas e na estrutura das paredes celulares das plantas e membranas das células animais.
Os aminoácidos são denominados porque possuem grupos amina (-NH 2 ) e ácido carboxílico (-CO 2 H). A maioria dos aminoácidos encontrados nos sistemas biológicos possui a fórmula geral R-CH (NH2) -CO2H, onde R é uma variedade de grupos. A estrutura variável de R é o que influencia a estrutura e as propriedades de peptídeos e proteínas.
A síntese peptídica ocorre quando um grupo amina de um aminoácido reage com o grupo ácido carboxílico em outro aminoácido. O resultado é a formação de um grupo amida da estrutura -N (H) -CO-, onde a ligação nitrogênio-carbono é chamada de ligação peptídica. A reação pode ocorrer várias vezes para formar uma sequência peptídica de diferentes grupos funcionais, cada um dos quais intercalado por um grupo amida.
Peptídeos e proteínas têm diferentes níveis de estrutura. Estrutura da proteína primária é a ordem na qual os aminoácidos são encontrados; esta é a sua sequência peptídica. Os grupos funcionais da proteína interagem entre si para formar uma forma. As voltas e reviravoltas individuais de um peptídeo são chamadas de estrutura secundária. Sua forma geral, o resultado líquido de todas essas voltas e reviravoltas, é a estrutura terciária do peptídeo.
As propriedades bioquímicas de proteínas ou peptídeos dependem da estrutura terciária. Como com todos os produtos químicos, as proteínas assumem a forma mais favorável em termos energéticos. Essa forma é causada por forças atraentes e repulsivas entre os grupos nos aminoácidos individuais. Portanto, a estrutura terciária se deve à estrutura primária, o que significa que a dedução da sequência peptídica de uma proteína específica acabará por explicar suas propriedades.
A elaboração da sequência peptídica de uma proteína tem aplicações na concepção de produtos farmacêuticos. Muitos processos biológicos dependem das ações das proteínas, e as drogas geralmente funcionam copiando ou bloqueando a ação dessas proteínas. Compreender o comportamento das proteínas pode levar ao design de medicamentos mais eficazes. Por esse motivo, o departamento de pesquisa e desenvolvimento de uma empresa farmacêutica normalmente possui uma biblioteca ou catálogo de peptídeos que será usado na busca de novos medicamentos.