Qu'est-ce qu'une séquence peptidique?
Les peptides sont des polymères biologiques formés par la liaison d'acides aminés, dont les éléments clés sont le carbone (C), l'hydrogène (H), l'oxygène (O) et l'azote (N). Le terme "séquence peptidique" désigne l'ordre dans lequel les acides aminés sont liés. Les peptides sont très importants dans les systèmes vivants et se combinent pour former des chaînes beaucoup plus grandes appelées protéines. Bien qu'il existe de nombreuses variétés de peptides biologiques, la plupart d'entre eux ne contiennent que 20 acides aminés. Les protéines remplissent diverses fonctions biologiques, notamment en tant qu’enzymes et dans la structure des parois cellulaires des plantes et des membranes dans les cellules animales.
Les acides aminés sont appelés ainsi parce qu'ils possèdent des groupes amine (-NH 2 ) et acide carboxylique (-CO 2 H). La plupart des acides aminés présents dans les systèmes biologiques répondent à la formule générale R-CH (NH 2 ) -CO 2 H, où R représente une gamme de groupes. La structure variable de R est ce qui influence la structure et les propriétés des peptides et des protéines.
La synthèse peptidique se produit lorsque le groupe amine d'un acide aminé réagit avec le groupe acide carboxylique sur un autre acide aminé. Le résultat est la formation d'un groupe amide de structure -N (H) -CO- où la liaison azote-carbone est appelée liaison peptidique. La réaction peut avoir lieu n'importe quel nombre de fois pour former une séquence peptidique de différents groupes fonctionnels, chacun d'eux étant entrecoupé d'un groupe amide.
Les peptides et les protéines ont différents niveaux de structure. La structure protéique primaire est l'ordre dans lequel se trouvent les acides aminés; c'est sa séquence peptidique. Les groupes fonctionnels de la protéine interagissent les uns avec les autres pour lui donner une forme. Les torsions individuelles d'un peptide s'appellent sa structure secondaire. Sa forme générale, le résultat net de tous ces rebondissements, est la structure tertiaire du peptide.
Les propriétés biochimiques des protéines ou des peptides dépendent de la structure tertiaire. Comme pour tous les produits chimiques, les protéines prendront la forme la plus énergiquement favorable. Cette forme est due aux forces attractives et répulsives entre les groupes sur les acides aminés individuels. Par conséquent, la structure tertiaire est due à la structure primaire, ce qui signifie que la déduction de la séquence peptidique d'une protéine particulière expliquera finalement ses propriétés.
L'élaboration de la séquence peptidique d'une protéine a des applications dans la conception de produits pharmaceutiques. De nombreux processus biologiques dépendent des actions des protéines, et les médicaments agissent souvent en copiant ou en bloquant l'action de ces protéines. Comprendre le comportement des protéines pourrait conduire à la conception de médicaments plus efficaces. Pour cette raison, le département de recherche et développement d'une entreprise pharmaceutique dispose généralement d'une bibliothèque de peptides ou d'un catalogue de peptides qu'il utilisera pour la recherche de nouveaux médicaments.