Wat zijn weefselmicroarrays?
Weefselmicroarrays, ook wel TMA's genoemd, zijn selecties van weefselkernen bereid in een paraffineblok en gerangschikt op een precieze manier. Histologische secties van de reeks kunnen uit het paraffineblok worden gesneden, wat resulteert in dunne plakjes van de met paraffine bereide weefselreeks die op een gewone microscoopglaasje kunnen worden geplaatst. Weefselmicroarrays worden gebruikt om een breed scala aan tests uit te voeren op talloze weefselmonsters die zich op een enkele microscoopglaasje bevinden, waardoor een hoge snelheid en precisie bij het experimenteren mogelijk is. Wetenschappers gebruiken bijvoorbeeld vaak weefselmicroarrays om genexpressie in normale en in pathologische weefsels te bepalen om genetica te gebruiken om verschillende ziekten te diagnosticeren.
Veel verschillende laboratoria, meestal in biologisch en gezondheidsonderzoek, gebruiken weefselmicroarrays om de efficiëntie en precisie te verbeteren waarmee ze verschillende experimenten op weefselmonsters kunnen uitvoeren. Immunohistochemie is bijvoorbeeld een proces waarbij fluorescerende middelen worden gehecht aan antilichamen die worden blootgesteld aan weefselmonsters op een microarray. De antilichamen binden aan specifieke antigenen op de weefselmonsters en onderzoekers kunnen deze binding identificeren vanwege de fluorescerende middelen. Bepaalde specifieke antilichamen binden aan specifieke antigenen, dus bindingsniveaus kunnen veel informatie bieden over de antigenen in een bepaald weefselmonster. Verschillende antigenen kunnen aanwezig zijn op normale of pathologische cellen; inzicht in het verschil kan zorgen voor een nauwkeurige diagnose van de ziekte en kan zelfs informatie opleveren die kan worden gebruikt om behandelingen voor verschillende ziekten te vinden.
Een vergelijkbare techniek die gewoonlijk wordt toegepast op weefselmicroarrays wordt Fluorescerende in situ hybridisatie of FISH genoemd. In FISH binden fluorescerende sondes aan bepaalde delen van chromosomen en kunnen worden gebruikt om informatie te vinden over de genetische samenstelling van een individu. Deze methode kan bijvoorbeeld worden gebruikt om genetische markers voor verschillende ziekten te identificeren. Zowel FISH- als immunohistochemie-methoden worden vaak gebruikt om behandelingen voor kanker te diagnosticeren en te identificeren.
Weefselmonsters kunnen moeilijk te verkrijgen zijn in significante hoeveelheden, en weefselmicroarrays hebben de neiging om wat tijd te kosten om te bereiden, dus onderzoekers moeten ervoor zorgen dat hun monsters intact blijven en dat de array correct is voorbereid. Weefsel moet bijvoorbeeld snel in paraffine worden verwerkt om bederf te voorkomen. Sommige onderzoekers kiezen ervoor om vooraf gemaakte weefselmicroarrays te kopen in plaats van ze zelf te produceren om fouten te voorkomen tijdens het voorbereiden van hun eigen weefselmicroarrays. Een andere overweging is het aantal monsters dat op een enkele dia moet worden geplaatst. Enkele honderden weefselkernen kunnen op een enkele dia worden geplaatst, maar het kan moeilijk zijn om zoveel kleine monsters bij te houden en precies te experimenteren.