Hvad er vævsmikroarrays?
Vævsmikroarrays, også omtalt som TMA'er, er selektioner af vævskerner fremstillet i en paraffinblok og arrangeret på en nøjagtig matrixform. Histologiske sektioner af arrayet kan skæres fra paraffinblokken, hvilket resulterer i tynde skiver af det paraffinforberedte vævsarray, der kan placeres på et almindeligt mikroskopglas. Vævsmikroarrayer bruges til at udføre en lang række test på adskillige vævsprøver indeholdt på et enkelt mikroskopglas, hvilket giver mulighed for stor hastighed og præcision i eksperimenteringen. Forskere bruger for eksempel ofte vævsmikroarrayer til at bestemme genekspression i normalt og i patologisk væv for at bruge genetik til at diagnosticere forskellige sygdomme.
Mange forskellige laboratorier, for det meste inden for biologisk og sundhedsundersøgelse, bruger vævsmikroarrays for at forbedre effektiviteten og præcisionen, hvormed de kan køre forskellige eksperimenter på vævsprøver. Immunohistokemi er for eksempel en proces, hvor fluorescerende midler er bundet til antistoffer, der udsættes for vævsprøver på en mikroarray. Antistofferne binder til specifikke antigener på vævsprøverne, og forskere kan identificere denne binding på grund af de fluorescerende stoffer. Visse specifikke antistoffer binder til specifikke antigener, så bindingsniveauer kan give en hel del information om antigenerne indeholdt i en given vævsprøve. Forskellige antigener kan være til stede på normale eller patologiske celler; forståelse af forskellen kan give mulighed for nøjagtig sygdomsdiagnose og kan endda give oplysninger, der kan bruges til at finde kurer for forskellige sygdomme.
En lignende teknik, der almindeligvis anvendes til vævsmikroarrays, kaldes fluorescerende in situ- hybridisering eller FISH. I FISH bindes fluorescerende prober til bestemte dele af kromosomer og kan bruges til at finde information om den enkeltes genetiske sammensætning. Denne metode kan for eksempel bruges til at identificere genetiske markører for forskellige sygdomme. Både FISH og immunohistokemi-metoder anvendes ofte til at diagnosticere og til at identificere behandlinger af kræft.
Vævsprøver kan være vanskelige at få i betydelige mængder, og vævsmikroarrays har en tendens til at tage ganske lang tid at forberede, så forskere skal sikre, at deres prøver forbliver intakte, og at matrixen er forberedt korrekt. Væv skal for eksempel hurtigt behandles i paraffin for at forhindre forfald. Nogle forskere vælger at købe færdiglavede vævsmikroarrays i stedet for at fremstille deres egne for at undgå fejl, mens de forbereder deres egne vævsmikroarrays. En anden overvejelse er antallet af prøver, der skal placeres på et enkelt objektglas. Flere hundrede vævskerner kan placeres på et enkelt objektglas, men det kan være vanskeligt at holde styr på og præcist eksperimentere med de mange små prøver.