Hva er vevsmikro-matriser?
Vevsmikroarrayer, også referert til som TMAer, er utvalg av vevskjerner fremstilt i en parafinblokk og anordnet på en nøyaktig matrisemåte. Histologiske seksjoner av oppstillingen kan kuttes fra parafinblokken, noe som resulterer i tynne skiver av det parafinforberedte vevssystemet som kan plasseres på et vanlig mikroskopskred. Tissue microarrays brukes til å utføre et bredt utvalg av tester på en rekke vevsprøver inneholdt på et enkelt mikroskopglass, noe som gir stor hastighet og presisjon i eksperimentering. Forskere bruker for eksempel ofte vevsmikroarrayer for å bestemme genuttrykk i normalt og i patologiske vev for å bruke genetikk for å diagnostisere forskjellige sykdommer.
Mange forskjellige laboratorier, for det meste innen biologisk og helsefaglig forskning, bruker vevsmikroarrayer for å forbedre effektiviteten og presisjonen som de kan utføre forskjellige eksperimenter på vevsprøver. Immunohistokjemi, for eksempel, er en prosess der fluorescerende midler er bundet til antistoffer som blir utsatt for vevsprøver på en mikroarray. Antistoffene binder seg til spesifikke antigener på vevsprøvene, og forskere kan identifisere denne bindingen på grunn av lysstoffene. Visse spesifikke antistoffer binder seg til spesifikke antigener, så bindingsnivåer kan gi mye informasjon om antigenene som er inneholdt i en gitt vevsprøve. Ulike antigener kan være til stede på normale eller patologiske celler; forståelse av forskjellen kan gi mulighet for nøyaktig sykdomsdiagnose og kan til og med gi informasjon som kan brukes til å finne botemidler for forskjellige sykdommer.
En lignende teknikk som ofte brukes på vevsmikroarrayer kalles Fluorescerende in situ hybridisering, eller FISH. I FISH bindes fluorescerende sonder til bestemte deler av kromosomer og kan brukes til å finne informasjon om individets genetiske sammensetning. Denne metoden kan for eksempel brukes til å identifisere genetiske markører for forskjellige sykdommer. Både FISH og immunohistokjemi metoder brukes ofte til å diagnostisere og for å identifisere behandlinger mot kreft.
Vevsprøver kan være vanskelige å få i betydelige mengder, og vevsmikroarrayer har en tendens til å ta ganske lang tid å tilberede, så forskere må sikre at prøvene deres forblir intakte og at matrisen er forberedt riktig. Vev må for eksempel raskt behandles i parafin for å forhindre forfall. Noen forskere velger å kjøpe ferdiglagde vevsmikroarrayer i stedet for å produsere sine egne for å unngå feil mens de forbereder sine egne vevsmikroarrayer. En annen vurdering er antall prøver som skal plasseres på et enkelt lysbilde. Flere hundre vevskjerner kan plasseres på et enkelt lysbilde, men det kan være vanskelig å følge med på og nøyaktig eksperimentere med mange små prøver.