Vad är strukturen för amylas?

Strukturen hos amylas, ett enzym som bryter ned stärkelse och komplexa sockerarter till enkla sockerarter, är vanligtvis ganska enkelt, men enzymet spelar en viktig roll i matsmältningen av kolhydrater. Det finns två olika variationer av denna molekyl, kallad alfa-amylas och beta-amylas. Den mänskliga kroppen har två typer av alfa-amylas, en i saliv och en i bukspottkörteln. Båda molekylerna är viktiga vid kolhydraterna, eftersom kroppen inte kan smälta komplexa sockerarter och stärkelser utan att först förstöra dem. Beta-amylas finns inte i människokroppen och finns vanligtvis i växter och frön.

Medan typen och strukturen för amylas kan variera mellan organismer, finns det några egenskaper som alla amylasmolekyler har gemensamt. Alfa- och beta-amylaser innehåller båda en struktur som kallas ett fatregion, vilket bidrar till mycket av enzymets totala form. Enzymerna har också alla ett viktigt område som kallas ett aktivt ställe. Detta är den del av enzymet som binder till ett komplex socker eller stärkelse för att bryta ner det. Processen att bryta ner kolhydrater i det aktiva stället involverar interaktioner mellan flera grupper av atomer och joner, både på det aktiva stället och på kolhydratmolekylen.

I människokroppen är strukturen hos amylas likadana oavsett om den finns i saliv eller i bukspottkörteln. Båda humana varianterna av amylas är små molekyler som består av en enda kedja av byggstenar som kallas aminosyror. Aminosyrakedjan bildar tre distinkta regioner som kallas domäner, och varje domän har en specifik biologisk funktion som hjälper till att kolhydratnedbrytningen. Två av dessa domäner är tätt associerade, medan den tredje domänen kan variera avsevärt bland amylaser. Trots deras likhet är saliv- och bukspottkörtelamylaser inte utbytbara; amylas i bukspottkörteln avslutar vanligtvis jobbet som salivamylas började.

Även om strukturen för amylas vanligtvis är enkel, finns det några varianter som är betydligt mer komplexa än de flesta. De flesta alfa-amylaser är väldigt lika långa, men vissa är mer än de tre vanliga domänerna. Vissa beta-amylaser är enorma jämfört med alfa-amylaser, som innehåller fyra separata aminosyrakedjor istället för en. I detta fall är en struktur av amylas fyra gånger större än de flesta andra byggd. Många bekanta livsmedelsgrödor innehåller denna typ av amylas, inklusive korn, sojabönor och sötpotatis, men storleken på amylasmolekylen gör ingenting för att förbättra eller minska växtens näringsegenskaper.