Co je polymorfismus délky fragmentu restrikčního fragmentu?
Polymorfismus délky fragmentu restrikčního fragmentu, neboli RFLP, je změnou homologních sekvencí DNA. Polymorfismy jsou změny v homologní DNA, které se vyskytují mezi jedinci, zatímco termín restrikci se týká skutečnosti, že malé části DNA lze vyříznout z velkého kusu pomocí restrikčních enzymů. Některé řezy DNA mají větší variabilitu než jiné a řezy s vysokým stupněm variability jsou užitečné při analýze polymorfismu s restrikčním fragmentem.
polymorfismus restrikční fragmenty se spoléhá na aktivitu restrikčních endonukleáz. Tato třída enzymu se nachází u mnoha bakteriálních druhů. V bakterii je úlohou restrikčních endonukleáz poskytovat ochranu proti cizí DNA, která získává přístup, rozdělením na kusy. V molekulárním výzkumu mohou být restrikční enzymy použity k fragmentu DNA na známých místech variability, aby bylo možné analyzovat výsledné fragmenty.R sekvence a působí k rozštěpení molekuly DNA v kterémkoli bodě, kdy rozpoznává sekvenci. Bakterie chrání svou vlastní DNA před porušováním výrazného vzoru methylace DNA, který zabraňuje vazbě endonukleáz restrikcí. Bylo objeveno více než 800 různých restrikčních endonukleáz, které společně rozpoznávají více než 100 jedinečných nukleotidových sekvencí. Většina uznávaných sekvencí je mezi čtyřmi a šesti párůmi bází.
Restrikční enzymy se používají v biotechnologii k analýze polymorfismu délky restrikčního fragmentu z různých důvodů. Enzymy se používají ke snížení délky DNA v určitých sekvencích, takže lze prozkoumat rozdíly mezi jednotlivci. Roztoky fragmentované DNA, řezané v určitých známých nukleotidových sekvencích, jsou hybridizovány sondami určenými k detekci předdefinovaných sekvencí DNA. Vzorky jsou poté analyzovány pomocí gelové elektroforézy.Tato technika vytváří gel s více pásy tmavého barvení, z nichž každý představuje odlišný fragment DNA. Zkoumáním vzoru barvení mohou vědci určit vzorec RFLP přítomných ve vzorku.
Polymorfismy se vyskytují široce v celém lidském genomu a jejich analýza prokázala, že různé skupiny lidí mají tendenci sdílet RFLP společné. Některé typy RFLP jsou běžné pro lidi různých etnických skupin nebo například geografického původu a propojení také existuje v rodinných skupinách. Tato variace existuje v celé království zvířat, což z ní činí užitečný výzkumný nástroj nejen pro sledování lidského původu, ale také pro studium migrace a vývoje volně žijících živočichů.
Analýza polymorfismů restrikční délky fragmentu může poskytnout užitečné informace pro klinické a lékařské účely. Polymorfism sondy restrikční fragmenty se používají v otcovských testech, v diagnostice dědičných onemocnění, ve forenzní vědě a v genotypizaci. AnaLyzingové vzorce RFLP na celém genomu jsou základem otisků prstů DNA, techniky, která je podporou všech těchto různých použití.