Co je TATA Box?
V živých organismech je transkripce kyseliny deoxyribonukleové (DNA) počátečním krokem nezbytným pro expresi genu. TATA box, také známý jako Goldberg-Hognessův box, je oblast DNA, která pomáhá iniciovat proces transkripce. Je součástí promotorové oblasti, která reguluje genovou expresi tím, že poskytuje vazebné místo pro enzymy podílející se na transkripci genů. TATA box se nachází v eukaryotech - organismech, které mají ve svých buňkách složité struktury vázané na membránu - včetně lidí.
DNA sestává z nukleotidů, opakujících se strukturálních jednotek, které přicházejí ve čtyřech variantách: nukleobáze adenin (A), thymin (T), guanin (G) a cytosin (C). Jak se tyto báze opakují, vytvářejí vzory, které kódují genetické informace. Také vytvářejí páry chemickou vazbou komplementárním způsobem, přičemž adenin se váže na thymin a guanin se váže na cytosin. Páry bází spojují dva řetězce molekuly DNA do struktury dvojité spirály.
Když je DNA přepsána, enzymy rozdělí dvojitou spirálu na vlákna, která ji tvoří, čímž odhalí genetický kód pro duplikaci. Každý řetězec DNA se používá jako templát pro syntézu řetězce ribonukleové kyseliny (RNA). Enzym známý jako RNA polymeráza konstruuje řetězec RNA vazbou komplementárních nukleobáz na každý exponovaný řetězec DNA.
Aby byly kompletní geny přepsány do messengerové RNA (mRNA) pro případnou expresi, musí RNA polymeráza zahájit transkripci ve správném bodě sekvence DNA. Tento bod, známý jako iniciační místo, je označen promotorovou oblastí, která se vyskytuje mírně před genem. TATA box je sekvence DNA, sestávající z nukleobáz TATAAA, umístěná v promotorové oblasti asi 25 párů bází před místem transkripce.
Proteiny známé jako transkripční faktory se vážou na TATA box. Jeden z nich, protein vázající TATA (TBP), je specifický pro TATA, zatímco ostatní mohou být schopné vázat se na non-TATA promotorové oblasti. RNA polymeráza je schopna rozpoznat přítomnost transkripčních faktorů jako signál, který se váže na toto místo. Po navázání na TATA box je RNA polymeráza v místě iniciace a nyní může začít transkribovat gen.
Většina promotorových oblastí genů neobsahuje krabici TATA. V genech bez TATA transkripční faktory rozpoznávají jiné promotorové sekvence a RNA polymeráza se na ně místo toho váže. Vědci objevili rozdíly v regulaci mezi geny s TATA boxem a geny bez TATA boxu studiem modelových organismů, jako jsou kvasinky Saccharomyces a ovocná muška Drosophila .