Was ist Microarray -Analyse?

DNA -Microarray -Analyse wird in der molekularen Biologie und der diagnostischen Medizin verwendet, um zu bestimmen, welche Gene in einer Zelle zu einem bestimmten Zeitpunkt eingeschaltet sind. Diese Technik wird als Multiplex -Assay bezeichnet, da sie Tausende von Proben in einem einzigen Assay messen kann. DNA -Mikroanalyse -Techniken werden verwendet, um Daten von Assays zu interpretieren, die sowohl auf RNA als auch auf DNA durchgeführt wurden, abhängig von den jeweiligen Anforderungen des Experiments. Ein Microarray -Analyse -Experiment wird an einer festen Oberfläche aus einem Glas oder einem Silikonchip durchgeführt, auf dem eine chemische Matrix gelegt wird. Auf der Oberfläche der Matrix -DNA- oder RNA -Sonden sind in ordnungsgemäßen Zeilen ausgerichtet.

Sobald der Chip mit den erforderlichen Sonden eingerichtet wurde, werden die untersuchten Zellen hergestellt. Um die Zellen vorzubereiten, müssen sie aufgeschlüsselt werden, damit die Nukleinsäuren, die sie enthaltenkann isoliert werden. Eine Reihe von Reagenzien wird zugesetzt, um die in den Zellen enthaltenen Nukleinsäuren zu extrahieren und zu konzentrieren. Als nächstes wird der Nukleinsäureextrakt zum Chip zugesetzt, der dann mehrere Stunden lang übrig bleibt, damit die Sonden interagieren und an die zellulären Nukleinsäuren binden können. Schließlich wird dem Chip eine weitere Reihe von Reagenzien zugesetzt, um Orte zu identifizieren, an denen Zellnukleinsäuren an Sonden gebunden sind.

Anschließend wird

Microarray -Analyse verwendet, um zu bestimmen, welche Sonden zelluläre Nukleinsäuren nachweisen konnten. Dies ist häufig eine komplexe Analyse, da ein einzelner Chip Zehntausende einzigartiger Sonden enthalten kann. Die Reihenfolge der Sonden auf dem Chip wird in einer Computerdatenbank gespeichert, damit die Ergebnisse leicht erzielt werden können. Unter Verwendung der Chip und der Datenbank kann ein Wissenschaftler eine Liste von Genen entwickeln, die an Sonden gebunden sind und daher im ursprünglichen Zelltrakt vorhanden waren.

Die Microarray -Analysetechnik wird üblicherweise bei der Genexpressionsprofilierung verwendet. In dieser Art von Experiment ist das Microarray eingerichtet, um Muster der Genexpression in Zellen zu untersuchen. Sonden für die interessierenden Gene sind im Microarray enthalten. Wenn das Experiment vollständig ist, kann die Microarray -Datenanalyse bestimmen, welche der untersuchten Gene zu einem bestimmten Zeitpunkt eingeschaltet wurden.

Andere Verwendungen für diese Technik umfassen vergleichende genomische Hybridisierung und SNP -Nachweis. Vergleichende genomische Hybridisierung ist ein Test, der den genomischen Gehalt in Zellen verwandter Organismen untersucht. Diese Art von Assay liefert Informationen über die genetischen Beziehungen zwischen verschiedenen Arten.

SNP -Erkennung ist eine Technik, die für die forensische Analyse, die genetische Verknüpfungsanalyse und die Bewertung genetischer Krankheitsrisiken verwendet werden kann. SNPs sind einzelne Nukleotidpolymorphismen, Orte auf dem Genom, an dem zwei mögliche Basenpaarsequenzen vorhanden sind. SNPs können eine Reihe nützlicher liefernGenetische Informationen aufgrund der Tatsache, dass in verschiedenen ethnischen und geografischen Populationen unterschiedliche SNP -Variationen bestehen.