Vad är mikroarray -analys?
DNA -mikroarrayanalys används i molekylärbiologi och diagnostisk medicin för att bestämma vilka gener i en cell som är påslagen vid en viss tidpunkt. Denna teknik är känd som en multiplexanalys, eftersom den kan mäta tusentals prover i en enda analys. DNA -mikroanalysstekniker används för att tolka data från analyser som utförts på RNA såväl som DNA, beroende på de speciella kraven i experimentet.
Grunden för DNA -mikroarray -analys är den höga specificiteten för DNA -molekyler och förmågan att välja unika sekvenser av DNA för att representera en viss gen. Ett mikroarray -analysexperiment utförs på en fast yta gjord av ett glas eller silikonchip på vilket läggs en kemisk matris. På ytan av matris -DNA eller RNA -sonderna är uppradade i ordnade rader.
När chipet har ställts in med de erforderliga sonderna bereds cellerna som studeras. För att förbereda cellerna måste de brytas upp så att de nukleinsyror de innehållerkan isoleras. En serie reagens tillsätts för att extrahera och koncentrera de nukleinsyror som finns i cellerna. Därefter tillsätts nukleinsyratxtraktet till chipet, som sedan lämnas i flera timmar för att möjliggöra tid för sonderna att interagera och binda till de cellulära nukleinsyrorna. Slutligen läggs en ytterligare serie reagens till chipet för att identifiera platser där cellulära nukleinsyror har bundits till sonder.
mikroarray -analys används sedan för att bestämma vilka sonder som har kunnat upptäcka cellulära nukleinsyror. Detta är ofta en komplex analys, eftersom ett enda chip kan innehålla tiotusentals unika sonder. Ordningen på sonderna på chipet lagras i en datordatabas så att resultaten enkelt kan erhållas. Med hjälp av chipet och databasen kan en forskare utveckla en lista över gener som har säkert till sonder och därför var närvarande i det ursprungliga cellulära extraktet.
Microarray -analystekniken används vanligtvis i profilering av genuttryck. I denna typ av experiment är mikroarray inställd för att undersöka mönster för genuttryck i celler. Sonder för generna av intresse ingår på mikroarray, och när experimentet är slutfört kan dataanalys av mikroarray bestämma vilka av de gener som studerades som var påslagen vid en viss tidpunkt.
Andra användningsområden för denna teknik inkluderar jämförande genomisk hybridisering och SNP -detektion. Jämförande genomisk hybridisering är ett test som undersöker genomiskt innehåll i celler i relaterade organismer. Denna typ av analys ger information om de genetiska förhållandena mellan olika arter.
SNP -detektion är en teknik som kan användas i kriminalteknisk analys, genetisk kopplingsanalys och bedömning av genetiska sjukdomsrisker. SNP: er är enstaka nukleotidpolymorfismer, platser på genomet vid vilka det finns två möjliga baspar-sekvenser. SNP: er kan ge en rad användbaraGenetisk information på grund av det faktum att olika SNP -variationer finns i olika etniska och geografiska populationer.