マイクロアレイ分析とは何ですか?
DNAマイクロアレイ分析は、分子生物学および診断医学で使用され、特定の時点で細胞内のどの遺伝子がスイッチオンされるかを決定します。 この手法は、1つのアッセイで数千のサンプルを測定できるため、マルチプレックスアッセイとして知られています。 DNA微量分析技術は、実験の特定の要件に応じて、RNAおよびDNAで実行されたアッセイからのデータを解釈するために使用されます。
DNAマイクロアレイ分析の基礎は、DNA分子の高い特異性と、特定の遺伝子を表すためにDNAのユニークな配列を選択する能力です。 マイクロアレイ分析実験は、化学マトリックスが置かれたガラスまたはシリコンチップから作られた固体表面で実行されます。 マトリックスの表面には、DNAまたはRNAプローブが整然と並んでいます。
チップが必要なプローブでセットアップされると、研究対象の細胞が準備されます。 細胞を準備するために、それらが含む核酸が分離できるように、それらは破壊されなければなりません。 細胞内に含まれる核酸を抽出および濃縮するために、一連の試薬が追加されます。 次に、核酸抽出物をチップに追加し、数時間放置してプローブが細胞核酸と相互作用して結合する時間を確保します。 最後に、さらに一連の試薬をチップに追加して、細胞核酸がプローブに結合した場所を特定します。
次に、マイクロアレイ分析を使用して、どのプローブが細胞核酸を検出できたかを判断します。 1つのチップに何万ものユニークなプローブが含まれている場合があるため、これは多くの場合複雑な分析です。 結果を簡単に取得できるように、チップ上のプローブの順序はコンピューターデータベースに保存されます。 科学者は、チップとデータベースを使用して、プローブに結合しているため元の細胞抽出物に存在していた遺伝子のリストを作成できます。
マイクロアレイ解析技術は、遺伝子発現プロファイリングで一般的に使用されています。 このタイプの実験では、細胞内の遺伝子発現のパターンを調べるためにマイクロアレイがセットアップされます。 目的の遺伝子のプローブがマイクロアレイに含まれており、実験が完了すると、マイクロアレイのデータ分析により、特定の時間に研究対象の遺伝子のどれがオンになったかを判断できます。
この技術の他の用途には、比較ゲノムハイブリダイゼーションおよびSNP検出が含まれます。 比較ゲノムハイブリダイゼーションは、関連生物の細胞内のゲノム含有量を調べるテストです。 このタイプのアッセイは、異なる種間の遺伝的関係に関する情報を提供します。
SNP検出は、法医学分析、遺伝連鎖分析、および遺伝病リスクの評価に使用できる手法です。 SNPは、単一ヌクレオチド多型であり、2つの可能な塩基対配列が存在するゲノム上の位置です。 SNPは、異なる民族および地理的集団に異なるSNPバリエーションが存在するという事実により、有用な遺伝情報の配列を提供できます。