Hvad er mikroarray -analyse?

DNA -mikroarray -analyse bruges i molekylærbiologi og diagnostisk medicin til at bestemme, hvilke gener i en celle der er tændt på et bestemt tidspunkt.Denne teknik er kendt som et multiplexassay, fordi den kan måle tusinder af prøver i et enkelt assay.DNA -mikroanalyseteknikker bruges til at fortolke data fra assays udført på RNA såvel som DNA, afhængigt af de særlige krav i eksperimentet.

Grundlaget for DNA -mikroarray -analyse er den høje specificitet af DNA -molekyler og evnen til at vælge unikSekvenser af DNA til at repræsentere et bestemt gen.Et mikroarray -analyseeksperiment udføres på en fast overflade fremstillet af en glas- eller silikone -chip, hvorpå der er lagt en kemisk matrix.På overfladen af matrix -DNA- eller RNA -proberne stilles op i ordnede rækker.

Når chippen er indstillet med de krævede sonder, fremstilles cellerne, der undersøges.For at fremstille cellerne skal de brydes åbne, så nukleinsyrerne, de indeholder, kan isoleres.En række reagenser tilsættes for at ekstrahere og koncentrere nukleinsyrerne indeholdt i cellerne.Dernæst tilsættes nukleinsyreekstrakten til chippen, som derefter efterlades i flere timer for at give tid til, at sonderne interagerer og binder til de cellulære nukleinsyrer.Endelig tilsættes en yderligere række reagenser til chippen for at identificere placeringer, hvor cellulære nukleinsyrer har bundet til sonder.

Microarray -analyse bruges derefter til at bestemme, hvilke sonder der har været i stand til at detektere cellulære nukleinsyrer.Dette er ofte en kompleks analyse, da en enkelt chip kan indeholde titusinder af unikke sonder.Rækkefølgen af sonderne på chippen gemmes i en computerdatabase, så resultaterne let kan opnås.Ved hjælp af chip og database kan en videnskabsmand udvikle en liste over gener, der har bundet til sonder og derfor var til stede i den originale cellulære ekstrakt.

Mikroarray -analyseteknikken bruges ofte i genekspressionsprofilering.I denne type eksperiment er mikroarray indstillet til at undersøge mønstre af genekspression i celler.Prober for generne af interesse er inkluderet i mikroarray, og når eksperimentet er afsluttet, kan mikroarray -dataanalyse bestemme, hvilken af de gener, der blev undersøgt, blev tændt på et bestemt tidspunkt.

Andre anvendelser til denne teknik inkluderer komparativ genomisk hybridisering og SNP -detektion.Sammenlignende genomisk hybridisering er en test, der undersøger genomisk indhold i celler af beslægtede organismer.Denne type assay giver information om de genetiske forhold mellem forskellige arter.

SNP -detektion er en teknik, der kan bruges i retsmedicinsk analyse, genetisk bindingsanalyse og vurdering af genetisk sygdomsrisici.SNP'er er enkelt nukleotidpolymorfismer, placeringer på det genom, hvor der er to mulige basispar-sekvenser.SNP'er kan give en række nyttige genetiske oplysninger på grund af det faktum, at der findes forskellige SNP -variationer i forskellige etniske og geografiske populationer.