O que é Análise de Microarray?
A análise de microarrays de DNA é usada na biologia molecular e na medicina de diagnóstico para determinar quais genes de uma célula são ativados em um determinado momento. Essa técnica é conhecida como ensaio multiplex, porque pode medir milhares de amostras em um único ensaio. Técnicas de microanálise de DNA são usadas para interpretar dados de ensaios realizados tanto em RNA quanto em DNA, dependendo dos requisitos particulares do experimento.
A base da análise de microarranjos de DNA é a alta especificidade das moléculas de DNA e a capacidade de escolher seqüências únicas de DNA para representar um gene específico. Um experimento de análise de microarranjos é realizado em uma superfície sólida feita de um chip de vidro ou silicone sobre o qual é colocada uma matriz química. Na superfície da matriz, as sondas de DNA ou RNA são alinhadas em fileiras ordenadas.
Depois que o chip é configurado com as sondas necessárias, as células em estudo são preparadas. Para preparar as células, elas devem ser quebradas para que os ácidos nucleicos que contêm possam ser isolados. Uma série de reagentes é adicionada para extrair e concentrar os ácidos nucleicos contidos nas células. Em seguida, o extrato de ácido nucleico é adicionado ao chip, que é deixado por várias horas para permitir tempo para as sondas interagirem e se ligarem aos ácidos nucleicos celulares. Finalmente, uma série adicional de reagentes é adicionada ao chip para identificar locais onde os ácidos nucleicos celulares se ligaram às sondas.
A análise de microarranjos é então usada para determinar quais sondas foram capazes de detectar ácidos nucleicos celulares. Geralmente, é uma análise complexa, pois um único chip pode conter dezenas de milhares de sondas exclusivas. A ordem das sondas no chip é armazenada em um banco de dados de computador, para que os resultados possam ser obtidos facilmente. Usando o chip e o banco de dados, um cientista pode desenvolver uma lista de genes que se ligaram às sondas e, portanto, estavam presentes no extrato celular original.
A técnica de análise de microarranjos é comumente usada no perfil de expressão de genes. Nesse tipo de experimento, o microarray é configurado para examinar os padrões de expressão gênica nas células. As sondas para os genes de interesse estão incluídas no microarray e, quando o experimento é concluído, a análise de dados do microarray pode determinar quais genes em estudo foram ativados em um determinado momento.
Outros usos para esta técnica incluem hibridação genômica comparativa e detecção de SNP. A hibridação genômica comparativa é um teste que examina o conteúdo genômico em células de organismos relacionados. Este tipo de ensaio fornece informações sobre as relações genéticas entre diferentes espécies.
A detecção de SNP é uma técnica que pode ser usada em análises forenses, análises de ligação genética e avaliação de riscos de doenças genéticas. SNPs são polimorfismos de nucleotídeo único, localizações no genoma em que existem duas possíveis sequências de pares de bases. Os SNPs podem fornecer uma variedade de informações genéticas úteis devido ao fato de que existem diferentes variações de SNP em diferentes populações étnicas e geográficas.