Qu'est-ce qu'un transcriptome?

Le transcriptome est une collection complète d'ARN d'un organisme, un groupe de cellules ou même une cellule spécifique. L'ARN est synthétisé à partir de l'ADN par un processus appelé transcription. L'ARN présente dans une cellule et le corps détermine quels gènes seront exprimés, et il change au cours de la vie d'un organisme, contrairement à l'ADN, qui reste statique. La pression environnementale est l'une des principales raisons des changements, car le corps tente de s'adapter à l'évolution des situations environnementales pour continuer à fonctionner.

Le transcriptome est beaucoup plus petit que le génome d'un organisme, la collection complète d'ADN dans l'organisme. En termes simples, on pourrait considérer l'ADN comme un livre de cuisine, répertoriant une collection complète de recettes qui peuvent être faites. Le transcriptome est le code qui détermine quelles recettes vont être fabriquées, et quand. Le livre de cuisine reste statique tout au long de la vie, tandis que le transcriptome change en réponse aux facteurs environnementaux.

Une partie importante du transcriptomE est des molécules d'ARNm. L'ARN messager est l'ARN qui communique avec les ribosomes dans les cellules pour diriger les cellules pour fabriquer diverses protéines. Ces protéines sont utilisées pour une grande variété de fonctions. D'autres parties peuvent ne pas coder directement pour la production de protéines, mais faire des choses comme déterminer la structure des cellules et réguler l'expression des gènes. Ensemble, les différentes composantes du transcriptome maintiennent un organisme fonctionnant et déterminent l'expression des gènes dans cet organisme.

Dans diverses cellules du corps, le transcriptome peut être très différent. Les cellules hépatiques, par exemple, ont de l'ARN qui en fait des cellules hépatiques et garantit que les cellules remplissent les fonctions nécessaires. Les cellules de la peau, en revanche, ont un transcriptome différent qui active les gènes nécessaires pour faire d'une cellule une cellule cutanée. Les cellules hépatiques et cutanées ont une copie complète du génome, mais leurs transcriptomes déterminent quelles parties dule génome est activé.

Tout comme avec l'ADN, il est possible de séquencer l'ARN. Le séquençage du transcriptome peut être effectué pour en savoir plus sur les actions d'une cellule et de l'ADN de l'organisme hôte, et pour identifier les lieux où l'expression des informations génétiques tourne mal. Lorsqu'une cellule hépatique devient maligne, par exemple, c'est parce que le transcriptome ne fonctionne pas comme il se doit, et que les gènes de malignité sont devenus activés, ou que les cellules manquent d'une régulation d'une manière ou d'une autre, ce qui les poussait à se développer hors de contrôle. Le séquençage de l'ARN dans une cellule maligne peut aider un chercheur à déterminer quel gène a été activé ou inactivé pour provoquer la malignité.