O que é um transcriptoma?
O transcriptoma é uma coleção completa de RNA de um organismo, um grupo de células ou mesmo uma célula específica. O RNA é sintetizado a partir do DNA através de um processo conhecido como transcrição. O RNA presente em uma célula e no corpo determina quais genes serão expressos e muda ao longo da vida de um organismo, diferentemente do DNA, que permanece estático. A pressão ambiental é uma das principais razões para mudanças, pois o corpo tenta se adaptar às mudanças nas situações ambientais para se manter funcionando.
O transcriptoma é muito menor que o genoma de um organismo, a coleção completa de DNA no organismo. Em termos simples, pode-se pensar no DNA como um livro de receitas, listando uma coleção completa de receitas que podem ser feitas. O transcriptoma é o código que determina quais receitas serão feitas e quando. O livro de receitas permanece estático ao longo da vida, enquanto o transcriptoma muda em resposta a fatores ambientais.
Uma parte importante do transcriptoma são as moléculas de mRNA. O RNA mensageiro é o RNA que se comunica com os ribossomos das células para direcionar as células para produzir várias proteínas. Essas proteínas são usadas para uma ampla variedade de funções. Outras partes podem não codificar diretamente a produção de proteínas, mas fazem coisas como determinar a estrutura celular e regular a expressão gênica. Juntos, os vários componentes do transcriptoma mantêm um organismo funcionando e determinam a expressão gênica dentro desse organismo.
Dentro de várias células do corpo, o transcriptoma pode ser muito diferente. As células hepáticas, por exemplo, possuem RNA que as torna células hepáticas e garante que as células desempenhem as funções necessárias. As células da pele, por outro lado, têm um transcriptoma diferente que ativa os genes necessários para transformar uma célula em uma célula da pele. As células do fígado e da pele têm uma cópia completa do genoma, mas seus transcriptomas determinam quais partes do genoma são ativadas.
Assim como no DNA, é possível sequenciar o RNA. O seqüenciamento do transcriptoma pode ser feito para aprender mais sobre as ações de uma célula e o DNA do organismo hospedeiro e para identificar os locais onde a expressão da informação genética dá errado. Quando uma célula hepática se torna maligna, por exemplo, é porque o transcriptoma não está funcionando como deveria e os genes para malignidade foram ativados, ou as células carecem de regulação de alguma forma, fazendo com que elas cresçam fora de controle. Seqüenciar o RNA em uma célula maligna pode ajudar um pesquisador a descobrir qual gene foi ativado ou inativado para causar a malignidade.