Co je transkript?

Transkriptom je úplná kolekce RNA z organismu, skupiny buněk nebo dokonce specifické buňky. RNA je syntetizována z DNA procesem známým jako transkripce. RNA přítomná v buňce a v těle určuje, které geny budou exprimovány, a mění se v průběhu života organismu, na rozdíl od DNA, která zůstává statická. Tlak na životní prostředí je jedním z hlavních důvodů změn, protože se tělo snaží přizpůsobit měnícím se okolním podmínkám, aby si udržel fungování.

Transkript je mnohem menší než genom organismu, úplná kolekce DNA v organismu. Jednoduše řečeno, dalo by se uvažovat o DNA jako o kuchařce, která by obsahovala kompletní sbírku receptů, které lze vyrobit. Transkript je kód, který určuje, které recepty se budou vyrábět a kdy. Kuchařka zůstává po celý život statická, zatímco transkript se mění v reakci na faktory prostředí.

Jednou důležitou součástí transkriptu jsou molekuly mRNA. Messenger RNA je RNA, která komunikuje s ribozomy v buňkách a řídí buňky tak, aby vytvořily různé proteiny. Tyto proteiny se používají pro širokou škálu funkcí. Jiné části nemusí přímo kódovat produkci proteinu, ale mohou dělat věci, jako je stanovení buněčné struktury a regulace genové exprese. Různé komponenty transkriptu společně udržují fungování organismu a určují genovou expresi v tomto organismu.

V různých buňkách v těle může být transkriptom velmi odlišný. Například jaterní buňky mají RNA, která z nich dělá jaterní buňky a zajišťuje, že buňky vykonávají nezbytné funkce. Na druhé straně kožní buňky mají odlišný transkriptom, který aktivuje geny nezbytné k tomu, aby se buňka stala kožní buňkou. Jak jaterní, tak kožní buňky mají úplnou kopii genomu, ale jejich transkripty určují, které části genomu jsou aktivovány.

Stejně jako u DNA je možné sekvenovat RNA. Je možné provést transkripční sekvenování, abychom se dozvěděli více o činnosti buňky a DNA hostitelského organismu a identifikovali místa, kde se projevuje genetická informace špatně. Když se například jaterní buňka stane maligní, je to proto, že transkriptom nefunguje tak, jak by měl, a aktivovaly se geny pro malignitu, nebo buňky nějakým způsobem nemají regulaci, což je způsobuje jejich růst mimo kontrolu. Sekvenování RNA v maligní buňce může pomoci vědci zjistit, který gen byl aktivován nebo inaktivován, aby způsobil malignitu.