Co je to transkriptom?

Transkriptom je úplná sbírka RNA z organismu, skupiny buněk nebo dokonce specifické buňky. RNA je syntetizována z DNA prostřednictvím procesu známého jako transkripce. RNA přítomná v buňce a těle určuje, které geny budou exprimovány, a změní se v průběhu života organismu, na rozdíl od DNA, která zůstává statická. Tlak prostředí je jedním z hlavních důvodů změn, protože se tělo pokouší přizpůsobit se měnícím se životním prostředí, aby se fungovala. Jednoduše řečeno, dalo by se myslet na DNA jako na kuchařku a uvádět kompletní sbírku receptů, které lze vyrobit. Přepis je kód, který určuje, které recepty budou vyrobeny a kdy. Kuchařka zůstává po celý život statická, zatímco transkriptom se mění v reakci na faktory prostředí.

Jedna důležitá část transkriptomuE jsou molekuly mRNA. Messenger RNA je RNA, která komunikuje s ribozomy v buňkách, aby nasměrovala buňky, aby vytvořily různé proteiny. Tyto proteiny se používají pro širokou škálu funkcí. Jiné části nemusí přímo kódovat produkci proteinů, ale dělají věci, jako je stanovení buněčné struktury a regulace genové exprese. Společně různé složky transkriptu udržují funkci organismu a určují expresi genu v tomto organismu.

V různých buňkách v těle může být transkriptom velmi odlišný. Například jaterní buňky mají RNA, která z nich činí jaterní buňky a zajišťuje, že buňky provádějí nezbytné funkce. Na druhé straně kožní buňky mají jiný transkript, který aktivuje geny nezbytné k tomu, aby se buňka stala buňkou kožní. Játra i kožní buňky mají úplnou kopii genomu, ale jejich transkriptomy určují, které částigenom je aktivován.

Stejně jako u DNA je možné sekvenovat RNA. Sekvenování transkriptomu lze provést, abyste se dozvěděli více o akcích buňky a DNA hostitelského organismu a pro identifikaci míst, kde se výraz genetických informací pokazí. Když se například jaterní buňka stane maligní, je to proto, že transkriptom nefunguje tak, jak by měl být, a geny pro malignitu byly aktivovány nebo buňky nějakým způsobem postrádají regulaci, což způsobuje, že vyrůstají z kontroly. Sekvenování RNA v maligní buňce může vědci pomoci zjistit, který gen byl aktivován nebo inaktivován, aby způsobil malignitu.