Wat is een transcriptie-eenheid?

Transcriptie is een proces dat in alle levende cellen plaatsvindt. Tijdens transcriptie worden RNA-strengen gemaakt op basis van het DNA dat in de cellen wordt gevonden. Wanneer een streng messenger-RNA (mRNA) wordt gemaakt, wordt dit tijdens de translatie gebruikt om eiwitten te produceren. Een hele DNA-streng wordt meestal niet in mRNA getranscribeerd, maar in plaats daarvan worden specifieke delen van het DNA wel transcriptie-eenheden genoemd.

Door de DNA-strengen heen die in cellen worden gevonden, zijn er sequenties van nucleotiden die coderen voor starts en stops. De enzymen die transcriptie uitvoeren, gebruiken deze codes om RNA-strengen te beginnen en eindigen. Een transcriptie-eenheid is de keten van nucleotiden in een DNA-streng die begint bij een startcode en doorloopt tot de eindcode.

Bij het verwijzen naar het stuk DNA dat in RNA wordt getranscribeerd, gebruiken veel wetenschappers de term 'transcriptie-eenheid' in plaats van 'gen'. Deze verandering in terminologie is tot stand gekomen omdat onderzoek heeft aangetoond dat het getranscribeerde DNA veel extra nucleotiden bevat die niet worden gebruikt om het eiwit te vormen. De secties van DNA die niet worden gebruikt om een ​​eiwit te coderen, worden introns genoemd en de secties die voor het eiwit coderen, worden exons genoemd.

Vaak worden er binnen een DNA-streng veel meer niet-coderende introns gevonden dan exons. Een gen is de term die wordt gebruikt om de sequentie van DNA-nucleotiden te beschrijven die codeert voor een eiwit. Er werd gedacht dat het continu was, maar onderzoek heeft aangetoond dat genen geen continue strengen zijn, maar worden opgedeeld in exons door de DNA-transcriptie-eenheid.

De transcriptie-eenheid bevat zowel introns als exons, die door het enzym RNA-polymerase in RNA worden gecodeerd. Nadat de mRNA-streng is geproduceerd en voordat deze wordt omgezet in een eiwit, worden de introns uit het RNA verwijderd. Splicing snijdt de introns van de streng van mRNA en verbindt vervolgens de resterende stukken samen om de laatste streng te vormen die zal worden gebruikt voor vertaling.

De laatste streng mRNA die wordt gemaakt nadat het splitsen heeft plaatsgevonden, is mogelijk niet altijd hetzelfde. Alternatieve splitsing verwijst naar het feit dat dezelfde introns kunnen worden verwijderd uit een streng mRNA, maar de exons kunnen op verschillende manieren samenkomen. Dit betekent dat een enkele transcriptie-eenheid in feite kan coderen voor verschillende eiwitten, vanwege het feit dat de uiteindelijke sequentie van de mRNA-streng verschillend kan zijn op basis van welke exons met elkaar zijn verbonden en in welke volgorde.