Hva er en mikrosatellitt?

En mikrosatellitt er en kort, repeterende sekvens av DNA. Siden de har en tendens til å variere lite mellom nært beslektede organismer, blir mikrosatellitter ofte brukt av forskere som genetiske markører for å identifisere individer som kommer fra den samme avlspopulasjonen. De er også kjent som korte tandemrepetisjoner (STRS) og enkle sekvensrepetisjoner (SSRS).

Hvis man tenker på et molekyl med DNA som ligner en stige, er hvert rung i stigen sammensatt av et par mindre molekyler kalt nukleotider. De fire nukleotidene som vises i DNA er adenin (A), guanin (G), tymin (T) og cytosin (C). Adenin par med tymin og guaninpar med cytosin. Rekkefølgen som disse baseparene vises gir en del av DNA sin unike signatur og utgjør en kode som lagrer genetisk informasjon.

En mikrosatellitt oppstår når en kort sekvens av basepar, vanligvis mellom 1 og 6, gjentar flere ganger på rad. Følgende diagram over en kort DNA -streng viser en enkeltMikrosatellitt sammensatt av enheten GTC på den øverste halvdelen og CAG på den nederste halvdelen, hver gjentatt 4 ganger. Forskere ville representere dette som (GTC) _{4 eller (CAG) 4 :}

        G T C G T C G T C G T C
        | | | | | | | | | | | |
        C a g c a g c a g c a g

Disse gruppene av gjentatte sekvenser ble kalt "Microsatellites" fordi når DNA er atskilt ved å snurre det i en sentrifuge, har det en tendens til å gruppere seg i et stort hovedbånd omgitt av mindre "Satellite" -bånd. Forskere heter DNA de fant i disse båndene minisatellitter og mikrosatellitter. Minisatellitter er lengre segmenter, som kan bestå av opptil 100 gjentatte basepar.

Mikrosatellittmarkører er ofte nyttige for å identifisere individer fra den samme avlspopulasjonen. Sjelden oppstår mutasjoner når en genetisk sekvens føres fra en forelder til barn, noe som resulterer i mer ellerfærre enheter av det gjentatte segmentet. I vårt eksempel over kan (CAG) _{4 bli (CAG) 3 eller (CAG) 5 . Disse mutasjonene forekommer ofte nok til at en vill avlspopulasjon sannsynligvis vil ha forskjellige mikrosatellitter enn andre avlsgrupper, men de forekommer sjelden nok til at individer i en enkelt avlsgruppe sannsynligvis vil dele visse karakteristiske sekvenser.}

De fleste mikrosatellitter finnes i ikke-kodende DNA-DNA som ikke har "kode" eller instruksjoner for å produsere protein. Følgelig antas de ikke å spille en betydelig rolle i cellefunksjonen. Det er imidlertid grunn til å tro at en mikrosatellitt kan forstyrre normale celleprosesser hvis den vokser for stort. For eksempel, i tilfelle av Huntingtons sykdom, kan antall gjentakelser av en viss sekvens bety forskjellen mellom å bli påvirket av sykdommen, eller være en ikke-berørt transportør.