Co to jest mikrosatelita?

Mikrosatelit jest krótką, powtarzalną sekwencją DNA. Ponieważ mają tendencję do niewielkiej różnorodności między blisko powiązanymi organizmami, mikrosatelity są często używane przez naukowców jako markery genetyczne do identyfikacji osób pochodzących z tej samej populacji hodowlanej. Są one również znane jako krótkie powtórzenia tandemowe (STR) i proste powtórzenia sekwencji (SSR).

Jeśli uważa się, że cząsteczka DNA przypomina drabinę, to każde szczeliny w drabinie składa się z pary mniejszych cząsteczek zwanych nukleotydami. Cztery nukleotydy, które pojawiają się w DNA, to adenina (A), guanina (G), tymina (T) i cytozyna (C). Adenina pary z tyminą i pary guaniny z cytozyną. Kolejność, w której pojawiają się te pary zasad , daje nici DNA jej unikalnego podpisu i stanowi kod, który przechowuje informacje genetyczne.

Mikrosatelit występuje, gdy krótka sekwencja par zasad, zwykle między 1 a 6, powtarza się kilka razy z rzędu. Poniższy schemat krótkiego nici DNA pokazuje jedenMikrosatelit złożony z jednostki GTC w górnej połowie i CAG w dolnej połowie, każda powtórzona 4 razy. Naukowcy reprezentowaliby to jako (GTC) _{4 lub (CAG) 4 :}

        G t c g t c g t c g t c
        |. |. |. |. |. |. |. |. |. |. |. |.
        C a g c a g c a g c a g

Te grupy powtarzających się sekwencji zostały nazwane „mikrosatelity”, ponieważ gdy DNA jest oddzielone przez wirowanie go w wirówce, ma tendencję do grupowania w duży główny pasek otoczony mniejszymi, „satelitarnymi” pasmami. Naukowcy nazwali DNA, które znaleźli w tych pasmach minisatelity i mikrosatelity. Minisatelity to dłuższe segmenty, które mogą składać się z około 100 powtarzających się par zasad.

Markery mikrosatelitarne są często przydatne do identyfikacji osób z tej samej populacji hodowlanej. Rzadko, mutacje występują, gdy sekwencja genetyczna jest przekazywana z rodzica na dziecko, co powoduje więcej lubmniej jednostek powtarzającego się segmentu. Zatem w naszym powyższym przykładzie (CAG) 4 może stać się (CAG) 3 lub (CAG) 5 . Mutacje te występują na tyle często, że populacja hodowli dzikiej prawdopodobnie będzie miała różne mikrosatelity niż inne grupy hodowlane, ale występują one rzadko, aby osoby w jednej grupie hodowlanej prawdopodobnie będą miały pewne charakterystyczne sekwencje.

Większość mikrosatelitów znajduje się w niekodującym DNA-DNA, który nie ma „kodu” ani instrukcji produkcji białka. W związku z tym nie uważa się, że odgrywają znaczącą rolę w funkcjonowaniu komórek. Istnieje jednak powód, by sądzić, że mikrosatelita może zakłócać normalne procesy komórkowe, jeśli rośnie zbyt duży. Na przykład w przypadku choroby Huntingtona liczba powtórzeń pewnej sekwencji może oznaczać różnicę między byciem dotkniętym chorobą lub byciem nośnikiem nie dotkniętym.