Hvad er en mikrosatellit?
En mikrosatellit er en kort, gentagen sekvens af DNA. Da de har en tendens til at variere lidt mellem tæt beslægtede organismer, bruges mikrosatellitter ofte af forskere som genetiske markører til at identificere individer, der kommer fra den samme avlspopulation. De er også kendt som korte tandem -gentagelser (STR'er) og enkle sekvens gentagelser (SSR'er).
Hvis man tænker på et molekyle af DNA som der ligner en Ladder, består hver af stigen af et par mindre molekyler kaldet nukleotider. De fire nukleotider, der vises i DNA, er adenin (A), guanin (G), thymin (T) og cytosin (C). Adeninpar med thymin og guaninpar med cytosin. Den rækkefølge, i hvilken disse basepar vises, giver en streng af DNA sin unikke signatur og udgør en kode, der gemmer genetisk information.
En mikrosatellit opstår, når en kort sekvens af basepar, normalt mellem 1 og 6, gentager flere gange i træk. Følgende diagram over en kort del af DNA viser en enkeltMikrosatellit sammensat af enheden GTC på den øverste halvdel og CAG på den nederste halvdel, der blev gentaget 4 gange. Forskere ville repræsentere dette som (GTC) 4 eller (CAG) 4 :
G T C G T C G T C G T C
| | | | | | | | | | | |
C a g c a g c a g c a g
Disse grupper af gentagne sekvenser blev navngivet "mikrosatellitter", fordi det, når DNA er adskilt ved at spinde det i en centrifuge, har en tendens til at gruppere sig i et stort hovedbånd omgivet af mindre "satellit" -bånd. Forskere navngav det DNA, de fandt i disse bånd minisatellitter og mikrosatellitter. Minisatellitter er længere segmenter, som kan bestå af op til ca. 100 gentagne basispar.
Mikrosatellitmarkører er ofte nyttige til at identificere individer fra den samme avlspopulation. Sjældent forekommer mutationer, når en genetisk sekvens overføres fra en forælder til barn, hvilket resulterer i mere ellerFærre enheder af det gentagne segment. I vores eksempel ovenfor (CAG) 4 kunne således blive (CAG) 3 eller (CAG) 5 . Disse mutationer forekommer ofte nok til, at en vild avlspopulation sandsynligvis har forskellige mikrosatellitter end andre avlsgrupper, men de forekommer sjældent nok til, at individer inden for en enkelt avlsgruppe sandsynligvis deler visse karakteristiske sekvenser.
De fleste mikrosatellitter findes i ikke-kodende DNA-DNA, som ikke har "koden" eller instruktioner til fremstilling af protein. Derfor antages de ikke at spille en betydelig rolle i cellefunktionen. Der er dog grund til at tro, at en mikrosatellit kan forstyrre normale celleprocesser, hvis den vokser for stor. For eksempel i tilfælde af Huntingtons sygdom kan antallet af gentagelser af en bestemt sekvens betyde forskellen mellem at blive påvirket af sygdommen eller at være en ikke-påvirket bærer.