Co je to mikrosatelit?

Mikrosatelit je krátká, opakující se sekvence DNA. Protože mají sklon se mezi organizmy blízce příbuznými málo měnit, vědci často používají mikrosatelity jako genetické markery k identifikaci jedinců, kteří pocházejí ze stejné chovatelské populace. Jsou také známé jako krátkých tandemových opakování (STR) a jednoduchých repetic sekvence (SSR).

Pokud si někdo myslí, že molekula DNA se podobá žebříku, je každá příčka v žebříku tvořena párem menších molekul nazývaných nukleotidy. Čtyři nukleotidy, které se objevují v DNA, jsou adenin (A), guanin (G), thymin (T) a cytosin (C). Adenin dvojice s thymin, guanin a cytosin. Páry se Pořadí, ve kterém se tyto páry bází dává řetězce DNA svůj jedinečný podpis a představuje kód, který ukládá genetické informace.

Mikrosatelit nastane, když krátké sekvence párů bazí, obvykle mezi 1 a 6, se opakuje několikrát za sebou. Následující diagram krátkého řetězce DNA ukazuje jediný mikrosatelit složený z jednotky GTC v horní polovině a CAG v dolní polovině, každý opakovaný 4krát. Vědci by představovalo to jako (GTC) ₄ nebo (CAG) _4:

         GTCGTCGTCGTC
         |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |
         CAGCAGCAGCAG

Tyto skupiny opakujících se sekvencí byly pojmenovány „mikrosatelity“, protože když se DNA oddělí odstředěním v odstředivce, má sklon seskupovat se do velkého hlavního pásma obklopeného menšími „satelitními“ pásy. Výzkumníci pojmenovali DNA našli v těchto pásmech minisatellites a mikrosatelitů. Minisatellites jsou delší segmenty, které se mohou skládat z až do asi 100 opakujících se párů bází.

Mikrosatelitní markery jsou často užitečné pro identifikaci jedinců ze stejné chovatelské populace. K mutacím dochází zřídka, když je genetická sekvence předána z rodiče na dítě, což má za následek více či méně jednotek opakujícího se segmentu. Tak, v uvedeném příkladu, (CAG) ₄ se může stát (CAG) ₃ nebo (CAG) _5. Tyto mutace se vyskytují natolik často, že divoká šlechtitelská populace bude pravděpodobně mít odlišné mikrosatelity než jiné šlechtitelské skupiny, ale vyskytují se občas natolik, že jednotlivci v jedné šlechtitelské skupině budou pravděpodobně sdílet určité charakteristické sekvence.

Většina mikrosatelity se nacházejí v nekódující DNA - DNA, která nemá „kód“ nebo instrukce pro výrobu proteinu. V důsledku toho se neříká, že hrají významnou roli ve fungování buněk. Tam je důvod věřit, nicméně, že mikrosatelity mohou narušit normální buněčné procesy, pokud to roste příliš velký. Například v případě Huntingtonovy choroby může počet opakování určité sekvence znamenat rozdíl mezi zasažením touto nemocí nebo neovlivněným nosičem.