Co je to Microarray?

Mikročip je sekvence teček DNA, proteinu nebo tkáně uspořádaných do pole pro snadnou simultánní analýzu. Nejslavnější je DNA microarray, která hraje nedílnou roli v profilování genové exprese. Materiálem substrátu je sklo, plast nebo křemíkový čip. Alternativní názvy pro microarray DNA zahrnují genový čip , DNA čip a biočip . Malé kousky DNA se nazývají sondy .

Mikročip může být vyroben mnoha způsoby. Nejprimitivnější je pouze pustit DNA na sklíčka pomocí kolíků. Sofistikovanější techniky využívají fotolitografii, elektrochemické přístupy a dokonce i inkoustový tisk - cokoli, co dokáže přesně doručit DNA na přesné místo.

DNA microarray je produktem koncem 80. a začátkem 90. let, kdy se biotechnologie skutečně začala vzlétat. Mikročip umožňuje vědci provádět posloupnost testů na všech vzorcích současně, což výrazně urychluje výzkum. Tradiční biologické experimenty pracují na věcech jeden po druhém. Sondy jsou někdy označeny tečkami zvanými fluorofory, pokud je nelze snadno rozeznat.

Některé z největších mikročipů vyrobených společnostmi, jako jsou NimbleGen Systems, obsahují až 390 000 spotů. Mikročip se často používá při analýze celého genomu organismu, který může obsahovat desítky chromozomů nebo více, každý s vlastní DNA a RNA. Bohužel ne všechny mikročipy jsou vzájemně kompatibilní a zjevně chybí standardy. Snahy o standardizaci probíhají, ale zatím bez velkého úspěchu.

Stejně jako většina nejmodernějších výzkumných programů v oblasti biotechnologií mohou testy na mikročipu produkovat obrovské množství údajů, což vede k oblasti bioinformatiky , která se snaží o to mít smysl. Mohou existovat objevy a korelace, které jsme již změřili, ale prostě jsme si nevšimli kvůli přetečení dat. Dolování dat se používá rozsáhle k analýze výsledků těchto složitých experimentů.