Cos'è un microarray?

Un microarray è una sequenza di punti di DNA, proteina o tessuto disposti su un array per una facile analisi simultanea. Il più famoso è il microarray del DNA, che svolge un ruolo fondamentale nella profilazione dell'espressione genica. Il materiale del substrato è vetro, plastica o un chip di silicio. I nomi alternativi per il microarray del DNA includono chip genico , chip DNA e biochip . I piccoli frammenti di DNA sono chiamati sonde .

Un microarray può essere realizzato in vari modi. Il più primitivo è semplicemente far cadere il DNA su vetrini con perni. Tecniche più sofisticate impiegano la fotolitografia, gli approcci elettrochimici e persino la stampa a getto d'inchiostro - tutto ciò che può offrire il DNA in un punto preciso con precisione.

Il microarray del DNA è un prodotto della fine degli anni '80 e dei primi anni '90, quando la biotecnologia ha davvero iniziato a decollare. Il microarray consente a un ricercatore di eseguire una sequenza di test su tutti i campioni allo stesso tempo, accelerando la ricerca drammatically. La sperimentazione biologica tradizionale funziona sulle cose una alla volta. Le sonde sono talvolta contrassegnate con punti chiamati fluorofores quando non possono essere facilmente raccontati.

Alcuni dei più grandi microarrays, realizzati da aziende tali sistemi Nimblegen, contengono ben 390.000 punti. Il microarray viene utilizzato frequentemente nell'analisi dell'intero genoma di un organismo, che può contenere dozzine di cromosomi o più, ognuno con il proprio DNA e RNA. Sfortunatamente, non tutti i microarray sono compatibili tra loro e c'è una manifesta mancanza di standard. Sono in corso gli sforzi di standardizzazione, ma senza ancora successo.

Come la maggior parte degli agende di ricerca biotecnologica all'avanguardia, i test sul microarray possono produrre enormi quantità di dati, dando origine al campo di bioinformatica , che cerca di dare un senso a tutto. Possono esistere scoperte e correlazioni cheCH abbiamo già misurato, ma semplicemente non ci siamo notati a causa dell'overlow dei dati. Il data mining viene ampiamente utilizzato per analizzare i risultati di questi esperimenti complessi.