Qu'est-ce qu'un microarray?
Un microréseau est une séquence de points d'ADN, de protéines ou de tissus disposés sur un tableau pour une analyse simultanée aisée. La plus connue est la puce à ADN, qui joue un rôle essentiel dans l'établissement du profil d'expression génique. Le substrat est du verre, du plastique ou une puce de silicium. Les noms alternatifs pour la puce à ADN incluent puce génétique, puce à ADN et biopuce . Les petits morceaux d'ADN s'appellent des sondes .
Un microréseau peut être fabriqué de différentes manières. Le plus primitif consiste simplement à déposer l'ADN sur des lames de verre à l'aide d'épingles. Des techniques plus sophistiquées font appel à la photolithographie, à des approches électrochimiques et même à l’impression par jet d’encre - tout ce qui peut livrer l’ADN à un endroit précis avec précision.
La puce à ADN est un produit de la fin des années 80 et du début des années 90, lorsque la biotechnologie a vraiment commencé à prendre son essor. Le microréseau permet au chercheur d’effectuer une séquence de tests sur tous les échantillons en même temps, accélérant ainsi considérablement les recherches. L'expérimentation biologique traditionnelle travaille sur des choses une à la fois. Les sondes sont parfois marquées avec des points appelés fluorofores quand ils ne peuvent pas être facilement distingués.
Certaines des plus grandes biopuces, fabriquées par des sociétés telles que NimbleGen Systems, contiennent jusqu'à 390 000 spots. Le microréseau est fréquemment utilisé pour analyser l’ensemble du génome d’un organisme, qui peut contenir des dizaines de chromosomes ou plus, chacun possédant ses propres ADN et ARN. Malheureusement, tous les microréseaux ne sont pas compatibles les uns avec les autres et les normes manquent manifestement. Des efforts de normalisation sont en cours, mais sans grand succès pour le moment.
Comme la plupart des agendas de recherche en biotechnologie de pointe, les tests sur le microréseau peuvent produire d’énormes quantités de données, donnant naissance au domaine de la bioinformatique , qui cherche à donner un sens à tout cela. Il peut exister des découvertes et des corrélations que nous avons déjà mesurées, mais qui ne sont tout simplement pas remarquées en raison du débordement de données. L'exploration de données est largement utilisée pour analyser les résultats de ces expériences complexes.