Hvad er en mikroarray?
En mikroarray er en sekvens af prikker af DNA, protein eller væv arrangeret på en matrix til let samtidig analyse. Den mest berømte er DNA-mikroarray, der spiller en integreret rolle i genekspressionsprofilering. Underlagsmaterialet er glas, plast eller en siliciumchip. Alternative navne på DNA-mikroarray inkluderer genchip , DNA-chip og biochip . De små bits af DNA kaldes sonder .
En mikroarray kan fremstilles på forskellige måder. Det mest primitive er kun at droppe DNA'et på glideskiver ved hjælp af stifter. Mere sofistikerede teknikker anvender fotolitografi, elektrokemiske fremgangsmåder og endda inkjetprint - alt hvad der kan levere DNA'et til et præcist sted nøjagtigt.
DNA-mikroarray er et produkt fra slutningen af 1980'erne og begyndelsen af 1990'erne, hvor bioteknologi virkelig begyndte at begynde. Mikroarray giver en forsker mulighed for at udføre en sekvens af tests på alle prøverne på samme tid og fremskynde forskningen dramatisk. Traditionel biologisk eksperimentering fungerer på tingene ad gangen. Proberne er undertiden markeret med prikker, der kaldes fluoroforer, når de ikke let kan skilles fra hinanden.
Nogle af de største mikroarrays, fremstillet af virksomheder såsom NimbleGen Systems, indeholder så mange som 390.000 pletter. Mikroarray bruges ofte til analyse af hele genomet til en organisme, der kan indeholde snesevis af kromosomer eller mere, hver med deres eget DNA og RNA. Desværre er ikke alle mikroarrays kompatible med hinanden, og der er en åbenlyst mangel på standarder. Standardiseringsindsats er i gang, men uden meget succes endnu.
Som de fleste banebrydende bioteknologiske forskningsagendaer, kan test på mikroarray producere enorme mængder data, hvilket giver anledning til området bioinformatik , der forsøger at give mening om det hele. Der kan forekomme opdagelser og sammenhænge, som vi allerede har målt, men simpelthen ikke bemærket på grund af overløbet af data. Data mining anvendes i vid udstrækning til at analysere resultaterne af disse komplekse eksperimenter.