¿Qué es un promotor proximal?
Un promotor proximal es una región en ácido desoxirribonucleico (ADN) justo antes del comienzo de un gen donde las proteínas y otras moléculas se unen en preparación para leer ese gen. La región promotora es esencial para que la mayoría de los genes se lean y transcriban en proteínas, tanto en células procariotas simples como en los eucariotas más complejos. Una variedad de proteínas llamadas factores de transcripción se unen al ADN en esta región, y realizan muchas tareas que se preparan para la transcripción génica. La más importante de estas funciones es construir un andamio de proteínas que mantiene el ADN abierto y transcribe el gen adecuado al mismo tiempo.
La ubicación y la estructura exacta de un promotor proximal varían entre los genes y los tipos de células. Las células procariotas, aquellas sin núcleo, generalmente tienen un tipo de promotor, mientras que las células eucariotas, aquellas con un núcleo verdadero, tienen otro. Los promotores generalmente se encuentran algunos nucleótidos aguas arriba o antes, el gen que controlan. Casi todos los promotores contienen una Señel EspecialENCE de nucleótidos que lo identifican como tal. En general, los promotores procariotas son identificados por un grupo de nucleótidos llamado secuencia de dalgarno shine, y los promotores eucariotas se identifican mediante una secuencia genética específica llamada caja tata.
A pesar de estas reglas relativamente simples, no todos los promotores proximales las siguen, lo que puede dificultar la identificación y los genes que controlan, algo difíciles. La distancia entre un promotor y su gen no se fija dentro de una especie o dentro de un solo organismo, por lo que determinar dónde se sientan en relación entre sí no es trivial. Las composiciones de secuencia promotora proximal no siempre son idénticas; Pueden muy longitud, composición o ambos. Además, las secuencias marcador de la caja Shine-Dalgarno o Tata tienen cierta variabilidad en ellas. Cómo los factores de transcripción variados reconocen los promotores frente a esta variabilidad inherente esNo es fácil de determinar, y los nuevos ejemplos aparecen con frecuencia que cuestionan estas soluciones previamente robustas.
Cuando un gen está muy cerca de otro gen, existe la posibilidad de que su promotor proximal pueda verse afectado por la acción del gen cercano. A veces, esto se hace a propósito en el genoma, tal vez para estimular múltiples genes a la vez o regular su acción simultáneamente. En otras ocasiones, una conexión entre dos genes a través de la actividad de un promotor se realiza por error. Para evitar esta conversación cruzada entre los genes donde no se justifica, algunos genomas tienen regiones aislantes entre ellos. Esta región adicional no siempre es necesaria, y algunos genomas evitan la conversación cruzada por el posicionamiento de genes de otras maneras, como obligar a un gen a estar inactivo, mientras que otro está activo.