近位プロモーターとは何ですか？

近位プロモーターは、タンパク質や他の分子がその遺伝子を読む準備で結合する遺伝子の始まりの直前に、デオキシリボヌクレ酸（DNA）の領域です。プロモーター領域は、ほとんどの遺伝子が単純な原核生物細胞とより複雑な真核生物の両方で、読み取りおよび転写されるために不可欠です。転写因子と呼ばれるさまざまなタンパク質がこの領域のDNAに結合し、遺伝子転写の準備をして多くのタスクを実行します。これらの機能の中で最も重要なのは、DNAを開いて同時に適切な遺伝子を転写するタンパク質の足場を構築することです。

近位プロモーターの正確な位置と構造は、遺伝子と細胞タイプ間で異なります。原核細胞、核のないものは通常、1つのタイプのプロモーターを持っていますが、真核細胞、真の核を持つ細胞には別の細胞があります。プロモーターは通常、それらが制御する遺伝子の上流またはそれ以前にいくつかのヌクレオチドを嘘をつきます。ほぼすべてのプロモーターには、特別なシーケーションが含まれていますそれをそのように識別するヌクレオチドの能力。一般に、原核生物プロモーターは、シャインダルガノ配列と呼ばれるヌクレオチドのグループによって特定され、真核生物プロモーターはTATAボックスと呼ばれる特定の遺伝的配列によって識別されます。

これらの比較的単純なルールにもかかわらず、すべての近位プロモーターがそれらに従うわけではなく、それらを識別することができます。プロモーターとその遺伝子の間の距離は、種または単一の生物内で固定されていないため、互いに関係する場所を決定することは些細なことではありません。近位プロモーター配列組成は必ずしも同一ではありません。それらは非常に長さ、構成、またはその両方が可能です。さらに、Shine-DalgarnoボックスまたはTataボックスのマーカー配列には、ある程度のばらつきがあります。この固有の変動に直面して、さまざまな転写因子がプロモーターをどのように認識するかは決定は簡単ではなく、これらの以前の堅牢なソリューションに疑問を投げかける新しい例が頻繁に表示されます。

遺伝子が別の遺伝子に非常に近い場合、その近位プロモーターが近くの遺伝子の作用によって影響を受ける可能性があります。時には、これはゲノムで意図的に行われ、おそらく複数の遺伝子を一度に刺激したり、同時にそれらの作用を調節したりすることがあります。それ以外の場合、プロモーターの活性を介した2つの遺伝子間の接続が誤って行われます。保証されていない遺伝子間のこのクロストークを防ぐために、一部のゲノムにはそれらの間に絶縁領域があります。この余分な領域は必ずしも必要ではありません。一部のゲノムは、他の遺伝子を不活性にすることを強制するなど、他の方法での遺伝子の位置によるクロストークを防ぎます。