Was ist ein proximaler Promotor?

Ein proximaler Promotor ist eine Region in der Desoxyribonukleinsäure (DNA) kurz vor Beginn eines Gens, in dem Proteine ​​und andere Moleküle in Vorbereitung binden, um dieses Gen zu lesen. Die Promotorregion ist für die meisten Gene, die in Protein gelesen und transkribiert werden, wesentlich in einfachen prokaryotischen Zellen und den komplexeren Eukaryoten. Eine Vielzahl von Proteinen, die als Transkriptionsfaktoren bezeichnet werden, binden an die DNA in dieser Region und führen viele Aufgaben aus, die für die Gen -Transkription vorbereitet werden. Das wichtigste dieser Funktionen besteht darin, ein Gerüst von Proteinen zu erstellen, das die DNA offen hält und gleichzeitig das richtige Gen transkribiert. Prokaryotische Zellen, die ohne Kern, haben normalerweise eine Art von Promotor, während eukaryotische Zellen, diejenigen mit einem echten Kern, eine andere haben. Promotoren liegen normalerweise ein paar Nukleotide stromaufwärts von oder zuvor dem Gen, das sie kontrollieren. Fast jeder Promotor enthält eine spezielle FortsetzungNukleotide, die es als solche identifizieren. Im Allgemeinen werden prokaryotische Promotoren durch eine Gruppe von Nukleotiden identifiziert, die als Shine-Dalgarno-Sequenz bezeichnet werden, und eukaryotische Promotoren werden durch eine spezifische genetische Sequenz identifiziert, die als Tata-Box bezeichnet wird.

Trotz dieser relativ einfachen Regeln folgt ihnen nicht jeder proximale Promotor, der sie identifizieren kann, und die Gene, die sie kontrollieren, schwierig. Der Abstand zwischen einem Promotor und seinem Gen ist weder innerhalb einer Art noch innerhalb eines einzelnen Organismus festgelegt. Es ist also nicht trivial, zu bestimmen, wo sie in Bezug aufeinander sitzen. Proximale Promotorsequenzzusammensetzungen sind nicht immer identisch; Sie können sehr in Länge, Komposition oder beides. Darüber hinaus haben die Markersequenzen der Shine-Dalgarno-Box oder der Tata-Box eine gewisse Variabilität. Wie die unterschiedlichen Transkriptionsfaktoren Promotoren angesichts dieser inhärenten Variabilität erkennen, istNicht leicht zu bestimmen, und neue Beispiele erscheinen häufig, die diese bisher robusten Lösungen in Frage stellen.

Wenn ein Gen einem anderen Gen sehr nahe ist, besteht die Möglichkeit, dass sein proximaler Promotor von der Wirkung des nahe gelegenen Gens beeinflusst werden kann. Manchmal erfolgt dies absichtlich im Genom, um möglicherweise mehrere Gene gleichzeitig zu stimulieren oder ihre Wirkung gleichzeitig zu regulieren. Zu anderen Zeiten erfolgt eine Verbindung zwischen zwei Genen durch die Aktivität eines Promotors fehlerhaft. Um dieses Übersprechen zwischen Genen zu verhindern, in denen es nicht gerechtfertigt ist, haben einige Genome Isolatorregionen zwischen ihnen. Diese zusätzliche Region ist nicht immer notwendig, und einige Genome verhindern das Übersprechen durch Genpositionierung auf andere Weise, wie ein Gen dazu zu zwingen, inaktiv zu sein, während ein anderes aktiv ist.