O que é um promotor proximal?

Um promotor proximal é uma região no ácido desoxirribonucleico (DNA) pouco antes do início de um gene em que proteínas e outras moléculas se ligam na preparação para ler esse gene. A região do promotor é essencial para a maioria dos genes a serem lidos e transcritos em proteínas, tanto nas células procarióticas simples quanto nos eucariotos mais complexos. Uma variedade de proteínas chamadas fatores de transcrição se ligam ao DNA nessa região e executam muitas tarefas que se preparam para a transcrição de genes. A mais importante dessas funções é a criação de um andaime de proteínas que mantém o DNA aberto e transcreve o gene adequado ao mesmo tempo.

A localização e estrutura exatas de um promotor proximal variam entre genes e tipos de células. As células procarióticas, aquelas sem núcleo, geralmente têm um tipo de promotor enquanto as células eucarióticas, aquelas com um núcleo verdadeiro, têm outro. Os promotores geralmente estão alguns nucleotídeos a montante ou antes do gene que eles controlam. Quase todo promotor contém uma sequência especialEnce de nucleotídeos que o identificam como tal. Em geral, os promotores procarióticos são identificados por um grupo de nucleotídeos chamado sequência Shine-Dalgarno, e os promotores eucarióticos são identificados por uma sequência genética específica chamada TATA Box.

Apesar dessas regras relativamente simples, nem todo promotor proximal as segue, o que pode tornar a identificá -las e os genes que eles controlam, um pouco difíceis. A distância entre um promotor e seu gene não é fixada dentro de uma espécie ou dentro de um único organismo, portanto, determinar onde eles se sentam em relação um ao outro não é trivial. As composições de sequência promotora proximal nem sempre são idênticas; Eles podem muito compridos, composição ou ambos. Além disso, as seqüências de marcadores da caixa SHINE-Dalgarno ou da Tata têm alguma variabilidade nelas. Como os variados fatores de transcrição reconhecem os promotores diante dessa variabilidade inerenteNão é fácil de determinar, e novos exemplos aparecem com frequência que questionam essas soluções anteriormente robustas.

Quando um gene está muito próximo de outro gene, existe a possibilidade de que seu promotor proximal possa ser afetado pela ação do gene próximo. Às vezes, isso é feito propositadamente no genoma, talvez para estimular vários genes de uma só vez ou regular sua ação simultaneamente. Em outros momentos, uma conexão entre dois genes através da atividade de um promotor é feita por erro. Para evitar essa conversa cruzada entre os genes onde não é justificado, alguns genomas têm regiões isolantes entre eles. Essa região extra nem sempre é necessária, e alguns genomas impedem a conversa cruzada pelo posicionamento de genes de outras maneiras, como forçar um gene a ficar inativo enquanto outro está ativo.