¿Qué es un contig?
Un contig, abreviatura de contiguo, se refiere a un segmento de ácido desoxirribonucleico (ADN) o al producto de segmentos superpuestos que forman una secuencia de ADN continua, extensa e ininterrumpida. Al estudiar mapas de estos segmentos, es posible descubrir el orden de los segmentos que comprenden varias secuencias, y los contigs se pueden agregar, eliminar o reorganizar para formar nuevas secuencias. El mapeo de ADN contig y las bibliotecas permiten a los investigadores identificar alineaciones que pueden causar enfermedades, proporcionar una mejor comprensión de cómo reaccionan las células bajo ciertas condiciones y permiten la capacidad de clonar características favorables en los organismos vivos.
Los contigs genómicos están conectados entre sí por la superposición de conjuntos etiquetados de secuencia coincidentes o por etiquetas de secuencia expresadas coincidiendo. Al comprender este proceso de bloque de construcción utilizado por las bases de los segmentos de ADN, los contigs pueden replicarse o clonarse en secuencias deseables, agregando o eliminando segmentos menos favorables. Los investigadores ven estas secuenciascomo mapas en programas de ADN computarizados altamente detallados. El programa proporciona un desglose visual de las bases utilizadas para construir los segmentos, y los segmentos utilizados para construir secuencias particulares. Utilizando diferentes esquemas de color, varios programas contig muestran esta información como secuencias bajas, medianas y de alta calidad.
El mapeo contig con frecuencia arroja luz sobre las causas de los trastornos genéticos. El síndrome de Williams, por ejemplo, produce síntomas de múltiples sistemas en niños, incluidos problemas cardiovasculares, niveles elevados de calcio en sangre y no prosperar. Los investigadores descubrieron deleciones de bandas que afectan ciertos genes, que pueden ser causados por la superposición inapropiada de contigs. Otro trastorno infantil genético, el síndrome de CRI-du-chat, también produce múltiples síntomas, cada uno de los cuales los científicos creen que se correlacionan con deleciones y posicionamiento anormal.
investigadores también analYZE Contig secuencias en especies de plantas. Cada planta contiene secuenciación exclusiva de esa planta, y al obtener mapas de especies de plantas individuales, los científicos descubren características similares y variables que pueden contribuir a la salud o el deterioro de un tipo de planta particular. Al analizar segmentos contig y secuencias en organismos que transportan enfermedades, los médicos pueden determinar los rasgos que luego pueden usarse en el desarrollo del tratamiento. El mapeo proporciona información visual sobre posibles manipulaciones genéticas a través de deleciones de secuencia o clonación.
Los científicos pueden cultivar muestras de ADN clonadas en cromosoma artificial bacteriano, cromosoma artificial de levadura, o en medios de cromosoma artificiales P1 o fago. Estos cromosomas contienen entre 50 y cientos de miles de bases, que compilan segmentos contig. Después de un período de colonización, las muestras se extraen usando una jeringa y se colocan en gel de secuenciación de ADN, que sufre electroforesis y secas. Un autoradiógrafo lee elMuestra y huellas digitales las secuencias. Los investigadores luego escanean la huella digital en un archivo de imagen, que luego puede cargarse en un programa contig.