Was ist ein Contig?
Ein Contig, kurz für zusammenhängende, bezieht sich entweder auf ein Desoxyribonukleinsäure -Segment (DNA) oder das Produkt überlappender Segmente, die eine kontinuierliche, umfangreiche, ununterbrochene DNA -Sequenz bilden. Durch die Untersuchung von Karten dieser Segmente ist es möglich, die Reihenfolge der Segmente zu ermitteln, die verschiedene Sequenzen umfassen, und Contigs können hinzugefügt, entfernt oder neu angeordnet werden, um neue Sequenzen zu bilden. Die DNA -Contig -Mapping und Bibliotheken ermöglichen es den Forschern, Ausrichtungen zu identifizieren, die Krankheiten verursachen, ein besseres Verständnis der Reaktion von Zellen unter bestimmten Bedingungen bieten und die Fähigkeit ermöglichen, günstige Eigenschaften in lebenden Organismen zu klonen.
Genomische Contigs sind durch die Überlappung von passenden Sequenzen mit Tagged -Sätzen oder durch Matching Expressions -Sequenz -Tags miteinander verbunden. Durch das Verständnis dieses Bausteinprozesses, der von den Grundlagen der DNA -Segmente verwendet wird, können Contigs repliziert oder in wünschenswerte Sequenzen klonieren und weniger günstige Segmente hinzufügen oder beseitigen. Forscher sehen diese Sequenzenals Karten zu sehr detaillierten, computergestützten DNA -Programmen. Das Programm bietet eine visuelle Aufschlüsselung der Basen, die zum Konstruktion der Segmente und der zum Erstellen bestimmten Sequenzen verwendet werden. Unter Verwendung verschiedener Farbschemata zeigen verschiedene CONIG -Programme diese Informationen als niedrige, mittelgroße und hochwertige Sequenzen an.
Contig -Mapping leuchtet häufig auf die Ursachen genetischer Störungen auf. Das Williams-Syndrom beispielsweise erzeugt bei Kindern, einschließlich kardiovaskulärer Probleme, Calciumspiegel mit erhöhtem Blut und gedeihen, mehr als Systemsymptome, einschließlich kardiovaskulärer Probleme. Die Forscher entdeckten Banddeletionen, die bestimmte Gene beeinflussten, die durch unangemessene Überlappung von Contigs verursacht werden können. Eine andere genetische Kindheitsstörung, das CRI-Du-Chat-Syndrom, erzeugt ebenfalls mehrere Symptome, von denen jeder glauben, dass Wissenschaftler mit Deletionen und abnormalen Positionierung korrelieren.
Forscher auch analYZE -Contig -Sequenzen in Pflanzenarten. Jede Pflanze enthält Sequenzierung, die für diese Pflanze einzigartig ist, und durch die Erlangung von Karten einzelner Pflanzenarten entdecken Wissenschaftler ähnliche und unterschiedliche Eigenschaften, die zur Gesundheit oder Verschlechterung eines bestimmten Pflanzentyps beitragen können. Durch die Analyse von Contig -Segmenten und -Sequenzen in Krankheitsbekämpfungsorganismen können Ärzte Merkmale bestimmen, die dann bei der Behandlung der Behandlungsentwicklung eingesetzt werden können. Die Zuordnung bietet visuelle Einblicke in mögliche genetische Manipulationen durch Sequenzdeletionen oder Klonen.
Wissenschaftler können klonierte DNA -Proben in bakteriellem künstlichem Chromosom, künstlichem Hefe -künstlichem Chromosom oder in P1- oder Phagen -künstlichen Chromosomenmedien anbauen. Diese Chromosomen enthalten 50 bis Hunderttausende von Basen, die Contig -Segmente zusammenstellen. Nach einer Kolonisationsphase werden Proben unter Verwendung einer Spritze extrahiert und in DNA -Sequenzierungsgel gelegt, die einer Elektrophorese und Trocknen unterzogen werden. Ein Autoradiograph liest dieBeispiel und Fingerabdrücke die Sequenzen. Forscher scannen dann den Fingerabdruck in eine Bilddatei, die später in ein CONIG -Programm geladen werden kann.